タンパク質チロシンキナーゼ7を共性アプタマーで細胞表面で標識し検出する
Savannah Albright1, Mary Cacace1, Yaniv Tivon1
1Department of Chemistry, University of Pittsburgh, Pittsburgh, Pennsylvania 15260, United States.
Journal of the American Chemical Society
|July 20, 2023
まとめ
癌マーカーPTK7のような標的タンパク質の正確なラベル付けを可能にするのは,特定の部位にラベルを転送することによってだ. この新しい方法により 細胞内のタンパク質発現と局所を追跡できます
科学分野:
- 生物化学
- 分子生物学
- 化学生物学
背景:
- 結合性アプタマーは,標的分子の選択的かつ迅速なラベル付けのために設計された核酸プローブです.
- これらの探査機は,高親和性および特異性を持つネイティブタンパク質に機能的ハンドルを接続するために,割れる電気フィルムを使用します.
- 既存のラベリング方法は,分解率や目標外の改変などの要因によって制限されることがあります.
研究 の 目的:
- 特定の細胞表面タンパク質への近接主導のラベル転送のための共性アプタマーの最初の適用を実証する.
- ガンにおける重要なバイオマーカーであるタンパク質チロシンキナーゼ7 (PTK7) を標的とし,標識する.
- タンパク質の動態を追跡するための細胞環境における共性アプタマーの有用性を検証する.
主な方法:
- タンパク質チロシンキナーゼ7 (PTK7) をターゲットに設計された共性アプタマーの開発と応用.
- 細胞外ドメインのPTK7にバイオチンを共性的に結合するために,近接駆動のラベル転送を使用します.
- PTK7の発現,局所化,細胞内化をモニタリングするテクニックを使用する.
主要な成果:
- PTK7の細胞外ドメインの特定のライシン残基へのアプタマー媒介バイオチンの成功移転.
- PTK7発現レベルと細胞の局所化を追跡する能力は,共性アプタマーラベリング戦略を使用しています.
- アプタマー媒介によるラベリングが確認され,PTK7の細胞内化をモニタリングすることが容易である.
結論:
- コバレンタルアプタマーは,細胞環境における標的タンパク質の正確なコバレンタル改変のためのプログラム可能なツールである.
- このアプローチは,発現,局所化,内部化を含む細胞表面タンパク質のダイナミクスの効果的な追跡を可能にする.
- この発見は,細胞イメージング,診断,治療の応用における共性アプタマーの可能性を強調しています.
関連する概念動画
Tagging and Fusion Proteins
6.7K
Proteins are involved in several cellular processes and biochemical reactions. Analyzing a specific protein of interest requires it to be isolated from the other proteins in the cell. This is achieved by overexpressing the specific gene in a suitable host to produce large quantities of the target protein. A tag or label is recombined with the gene to produce a fusion protein containing the target protein and the tag. The tags on these fusion proteins can then be used for easy detection and...
6.7K
Receptor Tyrosine Kinases
13.2K
Receptor tyrosine kinases or RTKs are membrane-bound receptors that phosphorylate specific tyrosine on protein substrates. RTKs regulate cellular growth, differentiation, survival, and migration. They contain an extracellular ligand binding domain, a transmembrane domain, and a cytosolic tail with intrinsic kinase activity. Several extracellular signaling molecules activate RTKs in one or more ways and relay the signal downstream. Ligands such as platelet-derived growth factor (PDGF) or...
13.2K


