固体相互換のシラン基割れ式リンクは,カスタムイソバリック定量化学タンパク質を可能にします
Nikolas R Burton1,2, Daniel A Polasky3, Flowreen Shikwana1,2
1Department of Biological Chemistry, David Geffen School of Medicine, University of California, Los Angeles, Los Angeles, California 90095, United States.
Journal of the American Chemical Society
|September 22, 2023
まとめ
新しい化学プロテオミクスを開発しました シラン基の分裂性同位体ラベルプロテオミクス (sCIP) です 機能生物学と薬の発見を 改善するためです この方法は,サンプル準備の効率を高め,エレクトロフィールとして作用するFCCPのような新しいシステイン-リガンド相互作用を特定します.
科学分野:
- プロテオミクス
- 化学生物学
- 薬物の発見
背景:
- 質量スペクトロメトリーに基づく化学タンパク質学は 機能生物学と薬剤発見に不可欠です
- 現存する方法は,試料の合成と試料の準備のスループットで課題に直面しています.
研究 の 目的:
- 新しい化学プロテオミクスのワークフローを確立し,現在の制限を克服するために,シランベースの割れる同位体ラベルプロテオミクスを (sCIP) 確立する.
- タンパク質とリガンドの相互作用を特定するために,高通量で効率的なサンプル準備と分析を可能にします.
主な方法:
- ディアルコキシディフェニルシラン フロレンリメチロキシカルボニル (DADPS-Fmoc) 保護されたアミノ酸のスケーラブルな合成を開発した.
- カスタマイズ可能な,同位体で標識され,化学的に割れるバイオチン捕獲反応剤を作成しました.
- MS1/MS2定量化によるsCIPが実装され,早期のラベリングとプーリングのためのクリックアセンブリされた同位体タグが搭載され,シックスプレックスマルチプレクスを可能にします.
主要な成果:
- sCIP方法はサンプル準備を効率化し,スループットとデータカバーを増加させます.
- sCIPは,FragPipe分析と組み合わせて,既知のシステイン-リガンドのペアと新しいペアを特定した.
- ミトコンドリア解離剤FCCPが共性逆性システイン反応性電化剤として機能することを発見した.
結論:
- sCIP方法は,化学プロテオミクスのための堅牢で効率的なプラットフォームを提供します.
- このアプローチは,システイン-リガンドの相互作用の包括的な識別を可能にすることによって,機能生物学と薬剤発見を前進させる.
- FCCPはシステインに反応する新鮮な作用メカニズムを示している.
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