マウスの中枢神経系の空間アトラス 分子解像度
Hailing Shi1,2, Yichun He1,3, Yiming Zhou1,2
1Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA, USA.
Nature
|September 27, 2023
まとめ
研究者はSTARmap PLUSを使って マウスの脳と脊髄の100万以上の細胞をマッピングし 3D分子アトラスを作成しました この空間的な細胞型アトラスは 新しい脳構造を明らかにし 遺伝子操作の研究を助けます
科学分野:
- 神経科学
- ゲノミクス
- バイオ情報学
背景:
- 脳の解剖学と機能を理解するには 3Dで分子細胞のタイプをマッピングする必要があります
- 単細胞RNAシーケンシングは細胞タイプをプロファイルしますが,空間的組織データはありません.
研究 の 目的:
- 大人のマウスの脳と脊髄の 高解像度3D分子アトラスを作成します
- 組織的な分子空間細胞型命名法を開発する.
- 空間トランスクリプトミクスを既存のアトラスと統合し,包括的なリソースを作成する.
主な方法:
- ナノスケールの解像度で1,022の遺伝子をプロファイルするために STARmap PLUSという in situ 配列法を使用した.
- 大人のマウスの脳と脊髄に 109万以上の細胞をマッピングしました
- 細胞セグメンテーション,クラスタリング,アノテーション,空間ニッチ分析のための計算パイプラインを開発しました.
主要な成果:
- 230の分子細胞タイプと106の分子組織領域を記述した.
- 既知の脳の解剖学を超えた 新しい組織構造を特定した
- STARmap PLUSデータと単細胞RNA配列アトラスを統合して11,844の遺伝子を割り当てる.
- AAV-PHP.eBトランスゲン配送ツールの描写されたウイルストロピズム.
結論:
- この研究は,分子空間アトラス,脳解剖学,遺伝子操作のアクセシビリティを統合した包括的な単細胞資源を提供します.
- この資料は哺乳類の中枢神経系の 分子機構の理解を進めている.
- 開発されたアトラスは,将来の神経科学の研究と治療開発の基盤として機能します.
