有効な非共性SARS-CoV-2メインプロテアース阻害剤のオープンサイエンスの発見
Melissa L Boby1,2,3, Daren Fearon4,5, Matteo Ferla6
1Pharmacology Graduate Program, Weill Cornell Graduate School of Medical Sciences, New York, NY 10065, USA.
Science (New York, N.Y.)
|November 9, 2023
まとめ
COVID Moonshot キャンペーンは,SARS-CoV-2 主なプロテアゼの新型非ペプチド阻害剤を発見した. このオープンサイエンスの取り組みは,将来のコロナウイルス薬の発見を加速させるための広範なデータを生成しました.
科学分野:
- 薬物の発見
- 構造生物学
- コンピュータ化学
背景:
- 重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2 (SARS-CoV-2) 主タンパク質は,抗ウイルス薬の開発における重要な標的である.
- 既存の阻害剤は,耐性または特異性で課題に直面する可能性があります.
研究 の 目的:
- オープンサイエンスでクラウドソーシングしたアプローチを用いて,SARS-CoV-2の主タンパク質の新型非ペプチド阻害剤を特定する.
- 将来のコロナウイルス薬発見の取り組みのために,包括的で公開可能な知識基盤を作成する.
主な方法:
- クラウドソーシング,機械学習,エクサスケール分子シミュレーション, 構造生物学と化学を活用しました
- 18,000以上の化合物のデザインを生成し 2,400以上の化合物を合成しました
- 広範な構造データ (490以上のX線構造) と生化学分析データ (10,000以上の測定) を収集した.
主要な成果:
- 鉛のような性質を持つ新しい非共性非ペプチド阻害基幹を発見した.
- SARS-CoV-2の主タンパク質の構造的な可塑性をマッピングした.
- 複数の化学型に対する広範な構造-活性関係を確立した.
結論:
- COVID Moonshotは有望な阻害剤のエスカフォルドを成功裏に特定し,豊富なオープンアクセスデータセットを生成しました.
- オープンサイエンスのクラウドソーシングモデルは 薬の発見を加速し,コロナウイルスと戦うための貴重なリソースを提供します.
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