キュルビット[8]ウリル 高親和性非末端二ペプチド部位を結合し,II型β回転を誘導する
Paolo Suating1, Lauren B Kimberly1, Marc B Ewe1
1Department of Chemistry, Trinity University, 1 Trinity Place, San Antonio, Texas 78212, United States.
合成受容体クキュルビット[8]ウリル (Q8) は,高親和性を持つ非末端ペプチド部位に効果的に結合する. この発見は,分子認識と結合相互作用を理解することによって,ペプチドの折り畳みアプリケーションを前進させます.
科学分野:
- 超分子化学
- 化学生物学
- 構造生物学
背景:
- ポリペプチドの非末端部位をターゲットにすることは困難です.
- 合成受容体はペプチドの認識に 新しいアプローチを提供します
研究 の 目的:
- 非末端ディペプチド部位に結合する合成受容体キュキュルビット[8] (Q8) をスクリーニングし,特徴づけること.
- Q8ペプチドの相互作用の分子基礎を解明する.
主な方法:
- テトラペプチドのスクリーニング
- アイソテルミック・タイトレーション・カロリメトリー (ITC)
- 核磁共振 (NMR) スペクトロスコーピー
- 質量スペクトロメトリー (MS)
- X線結晶検査です
主要な成果:
- Q8は,それぞれ60nmと86nmの解離定数を持つ非末端ダイペプチドサイトLys-Phe (KF) とPhe-Lys (FK) に対して高い親和性を示した.
- X線結晶学では,LeuとTyrのサイドチェーンを含むペアインクルージョンモチーフが明らかになった.
- 認識には,水素結合とQ8誘発型II型β回転が含まれています.
結論:
- Q8は未修正の非末端ペプチド部位に対する前例のない親和性を表しています.
- 詳細な構造の洞察はペプチドベースのアプリケーションの設計を容易にする.
- このシステムは,リガンド誘発ポリペプチドの折り畳み戦略を可能にします.
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