単細胞トランスクリプトミクスとプロテオミクス画像を用いて,ヒトの骨髄ニッチの細胞生物地理をマッピングする

科学分野:

• 血液学
• 細胞生物学
• ゲノミクス
• 空間生物学

背景:

• 非血液形成細胞は,血液形成 (血液形成) に不可欠である.
• 人間の骨髄におけるそれらの多様性と空間的配置は 十分に理解されていない.
• これらの細胞を理解することは 血液形成の解読の鍵です

研究 の 目的:

• ヒトの骨髄における非血液形成細胞の異質性と空間的組織を特徴づける.
• 血液形成に影響する細胞の相互作用をマッピングする.
• 急性骨髄白血病 (AML) に伴う骨髄の空間的変化を特定する.

主な方法:

• 単細胞RNAシーケンシング (scRNA-seq) で,非血液形成細胞と血液形成細胞をプロファイルする.
• 120万以上の細胞の空間プロファイリングのためのインデックスによる共同検出 (CODEX).
• scRNA-seqとCODEXデータを統合して,シグナリングと空間的近接をリンクする.

主要な成果:

• 9つの異なる非血液形成細胞のサブタイプを特定した.
• 早期骨髄形成の 酸素濃度の高い動脈末骨の穴を発見した
• 早期の造血幹細胞と原始細胞 (HSPC) のアディポサイト的局所化を発見した.
• AML患者のサンプルでメゼンキマ・ストロマル細胞 (MSC) 拡大と特定の空間的近隣を明らかにした.

結論:

• 人間の骨髄の空間的に解明された多原子アトラスを開発した.
• このアトラスは血液形成における細胞相互作用の研究の参考となる.
• AMLの異なる細胞ニッチと空間的変化を特定し,MSCの役割を強調しました.