発達中の人間の脳における遺伝子,イソフォーム,およびスプライシングの規則のクロスアセンストリーアトラス
Cindy Wen1,2,3, Michael Margolis2,3, Rujia Dai4
1Interdepartmental Program in Bioinformatics, University of California, Los Angeles, Los Angeles, CA 90095, USA.
まとめ
この研究では 自閉症や統合失調症のような 神経精神疾患に関連した遺伝子を特定するために 人間の脳の発達における 規制要素をマッピングしています イソフォームの調節を明らかにします.
科学分野:
- 神経科学
- 遺伝学
- 発達生物学
背景:
- 神経精神科の全ゲノム関連研究 (GWAS) は,発達中の脳の規制要素の強化を示しています.
- リスク遺伝子やメカニズムの 優先順位付けは 脳の発達に関する 統一された規制アトラスがないと 難しいのです
研究 の 目的:
- 発達中の人間の脳に関する 総合的なアトラスを作成する
- 神経精神疾患の根底にある遺伝子と規制メカニズムを特定し優先する.
主な方法:
- 672人の発達中のヒトの脳にわたる遺伝子,同型,および量的な特徴の位置 (QTLs) のスプライシングを分析した.
- QTLを特定の細胞文脈にマッピングし,遺伝子発現の遺伝性を分析した.
- 共同表現ネットワークを使用してGWASのロキと文脈化された発見のためのメカニズムを優先するためにコロカライゼーションを使用しました.
主要な成果:
- QTLsを制御する15752の遺伝子を特定し, 3739を細胞の文脈にマッピングしました.
- 細胞の異質性と神経細胞の成熟に関連した,発達中の遺伝子発現の遺伝性の低下を観察した.
- アイソフォームのレベル調節は,特に第2 trimesterでは,GWASの遺伝性に大きく貢献しました.
- 5つの疾患でGWASの約60%のメカニズムを優先し,成人の脳の研究を上回っています.
結論:
- 神経精神疾患の理解には 発達中の脳の 統一された制御アトラスが不可欠です
- アイソフォームの調節は脳の発達中の遺伝的リスクを媒介する上で重要な役割を果たします.
- このアトラスは,発達と疾患におけるトランスクリプトームの規制の包括的な風景を提供します.
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