ヒトのSARS-CoV-2への挑戦は,局所および全身の反応の動態を明らかにする

科学分野:

• 免疫学
• ウイルス学
• ゲノミクス

背景:

• COVID-19 パンデミックは,SARS-CoV-2に対する早期の細胞免疫を理解する際のギャップを浮き彫りにしています.
• 初期感染段階における宿主反応の時間的動態に関する知識は限られている.

研究 の 目的:

• 単細胞マルチオミクスを用いて,一時的に中断した,一時的な,持続したSARS-CoV-2感染を解決する.
• 初期感染時に表皮細胞と免疫細胞のダイナミックな細胞反応を特定する.
• 継続的な感染に対する保護に関連した早期の免疫反応を調査する.

主な方法:

• SARS-CoV-2に感染した血清陰性個体からの鼻のスランプと血液の単細胞マルチオミクスプロファイリング.
• 細胞型比率と細胞応答状態の時間分析
• 抗原反応性T細胞を特定するためのCell2TCR計算パイプラインの開発と応用.

主要な成果:

• 細胞型の割合と動的細胞応答の急速な変化が観察されました.
• 血液中のインターフェロンの反応は鼻の反応に先行した.
• 早期の鼻内免疫浸透は一時的な感染と相関し,後の浸透は持続的な感染と相関する.
• 高いHLA- DQA2発現は,予防接種前の長期感染に対する保護と関連していた.
• シリア細胞はウイルスの複製に高い許容性を示し,T細胞とマクロファージは非生産的な感染を示した.
• SARS-CoV-2 モチーフが収束したクローン的に拡張したT細胞を含む54のT細胞状態が特定されました.

結論:

• 詳細なタイムシリーズのデータは,SARS-CoV-2に対する表皮細胞と免疫細胞の反応の包括的な見方を提供します.
• 早期のダイナミックな免疫反応は,持続的な感染に対する保護と関連しています.
• Cell2TCRパイプラインは,抗原反応性T細胞の識別とクラスタリングに役立ちます.