3 次元 の ゲノム の 構造 は 52,000 年 の 古い マンモット の 皮膚 の サンプル に 存在 し て い ます

科学分野:

• パレオゲノミクス
• 分子生物学
• 進化生物学

背景:

• 古代DNA (aDNA) の分析は通常,断片化されたDNAと現代的な親戚との比較に依存しています.
• 高級構造を含む古代ゲノム構造の保存は 研究に困難です

研究 の 目的:

• マンモスのゲノム構造の 保存状態を調査するためです
• マンモスのゲノムとその構造的組織を組み立て,分析するための高度な技術を活用する.

主な方法:

• パレオHi-Cは古代マモスの皮膚の染色体との接触をマッピングするために使われました
• ゲノムアセンブリが行われ クロモソームの長さのエスカフォードが生成されました
• 現代ゾウの組織を比較した分析が行われた.

主要な成果:

• 5万2千年前の マンモスの毛皮は 古代のゲノム構造を保ちました
• 染色体領域,コンパートメント,ループ,バール体,非活性X染色体 (Xi) スーパードメインが特定されました.
• マンモスのゲノム部位は 他のゾウの組織よりも アジアゾウの皮膚に 近いことを示しました
• マンモスのXiは,人間とマウスの二重構造と異なるユニークなテトラディックアーキテクチャを示しました.

結論:

• 古代マモスのDNAは 複雑なゲノム構造を保存し 絶滅した種への ユニークな窓を開くことができます
• マンモスとゾウの遺伝子転写レベルでの 規制上の潜在的な違いが 比較分析によって明らかになった.
• 保存メカニズムは,試料の自発的な冷凍乾燥とガラス化を含みます.