マルチスケール光触媒的近接ラベルは,細胞内および細胞間の細胞表面の隣人を明らかにします

科学分野:

• 生物化学
• プロテオミクス
• 細胞生物学

背景:

• 細胞内のタンパク質の相互作用に関する洞察を提供している.
• 既存のPLP方法は解像度と範囲に制限があります.

研究 の 目的:

• タンパク質の近隣をマッピングするための調整可能な解像度を持つ多スケールPLP方法を開発する.
• 腫瘍性表皮成長因子受容体 (EGFR) と細胞間シナプスのタンパク質相互作用をプロファイルする.

主な方法:

• 可視光で活性化されたEosin Yという 商業的に利用可能な光触媒を使用した.
• マルチスケール分析のために,ラベリング半径が異なるフォトプローブを使用した.
• 免疫測定法とアルファフォールド-マルチマーの予測を用いて検証されたタンパク質の隣人.

主要な成果:

• EGFRのタンパク質近隣を成功裏にプロファイリングし,20以上の確認された近隣を特定しました.
• T細胞エンゲージャーとCAR T細胞によって誘発された細胞-細胞シナプスのタンパク質ネットワークをマッピングした.
• 細胞表面と細胞間の局所的および遠隔のタンパク質ネットワークをマッピングするプラットフォームの能力を実証しました.

結論:

• 統合されたマルチスケールPLPプラットフォームは,細胞表面の相互作用マッピングのための強力なツールを提供します.
• このアプローチは,水平のシグナリングパートナーと潜在的な免疫療法標的を特定するのに役立ちます.
• この方法は,様々な生物学的調査のために調整可能な解像度を提供します.