E. coliのリボソームRNAには,挿入配列IS1とIS2と同類の配列が含まれています

科学分野:

• 分子生物学は分子生物学である.
• 遺伝学 遺伝学とは
• 微生物学 微生物学とは

背景:

• 挿入配列 (IS) 要素は,Escherichia coli染色体内の複数のコピーで発見された移植可能な遺伝要素です.
• IS要素は遺伝子発現を潜在的に調節することが知られているが,遺伝子制御における正常な機能は不明である.
• IS要素の機能的役割を理解することは,細菌のゲノム調節と進化を理解するために不可欠です.

研究 の 目的:

• IS要素が特定のRNAトランスクリプトを通じて遺伝的コントロールを行使できるかどうかを調査する.
• IS要素とバクテリアの細胞成分間の潜在的なRNA媒介の相互作用を特定する.
• IS要素と他の遺伝物質の間の配列ホモロジーの機能的意義を探求する.

主な方法:

• ラムダNNC1857 r14 (IS1を含む) とpBR322 (IS2を含む) をE. coli RNAの北方ブラットにハイブリッド化した.
• 核酸塩基配列のコンピュータ解析は,IS要素,リボソームRNA (rRNA),およびその他の遺伝要素の間のホモロジーを検出します.
• 比較シーケンス分析により,特定の同類領域とその潜在的な機能的影響を特定します.

主要な成果:

• IS1とIS2の要素と23Sと16Sの両方のリボソームRNA (rRNA) の間で重要なホモロジー領域が観察されました.
• IS要素と phi X174 DNA,およびリボソームタンパク質遺伝子クラスターリーダー領域の間の追加の同類配列が特定されました.
• IS2と16SrRNAの間の特定の同類配列は,phi X174 DNAのコーディング領域と重複することが判明しました.

結論:

• 観察されたホモロジーは,IS要素がリボソームRNAと相互作用し,遺伝子発現に影響を与える可能性があることを示唆しています.
• これらの部分的なIS配列は,進化の残骸を表すか,これらの配列を含む遺伝子の発現を調節することに積極的に参加する可能性があります.
• IS要素がRNA相互作用を通じて遺伝子発現を調節する正確なメカニズムを明らかにするために,さらなる研究が必要である.