アミノメチルサリチアルデヒドは,拡張された分子内水素結合ネットワークを形成することによって,表面ライシンにロックされます
Jacqueline Weaver1, Gregory B Craven2, Linh Tram1
1Chemistry and Chemical Biology Program, University of California─San Francisco, San Francisco, California 94143, United States.
研究者は,Hsp90の表面露出ライシン残基を効果的に標的とする新しいサリチアルデヒドリガンドを開発した. これらのリガンドは安定したイミンを形成し,タンパク質の改変と薬物開発のための新しい戦略を提供します.
科学分野:
- 生物化学
- 化学生物学
- 構造生物学
背景:
- 特定のライシン改変のための電離性リガンドの開発は困難である.
- サリチアルデヒド阻害剤は通常,タンパク質キナーゼに埋もれたリジン残基を標的とする.
- 溶媒に曝露されたライシン部位におけるサリシラルディミンアダクトの安定性は不確実である.
研究 の 目的:
- 表面に露出するライシン残基に対するサリチルアルデヒドベースの阻害剤の有効性を調査する.
- 熱ショックタンパク質90 (Hsp90) のATPアゼドメインを標的とする新しいリガンドを開発する.
- 水解に抵抗するイミン添加物を作るための戦略を探求する.
主な方法:
- アミノメチル置換サリチアルデヒドの合成
- Hsp90でリガンド結合とレジデンス時間を測定する.
- リガンド-タンパク質複合体の結晶分析
主要な成果:
- Hsp90の表面ライシンを標的にする長い滞在時間を持つ塩素アルデヒドリガンドを特定した.
- 鉛化合物とHsp90のほぼ不可逆的な結合を達成した.
- 分子内水素結合によるイミン安定性の構造的基礎を明らかにした.
結論:
- アミノメチルサリチアルデヒドは,溶媒にさらされたライシン残基で,形状的に安定した,水解性イミンを形成することができる.
- この戦略は,ライシンがリガンド結合部位から遠く離れている場合でも有効です.
- 標的型タンパク質変調剤の開発のための潜在的プラットフォームを提供します.
さらに関連する動画
11:13Covalent Immobilization of Proteins for the Single Molecule Force Spectroscopy
Published on: August 20, 2018
08:29Au-Interaction of Slp1 Polymers and Monolayer from Lysinibacillus sphaericus JG-B53 - QCM-D, ICP-MS and AFM as Tools for Biomolecule-metal Studies
Published on: January 19, 2016
関連する概念動画
Ligand Binding Sites
Protein-ligand interactions are quite specific; even though numerous potential ligands surround a cellular protein at any given time, only a particular ligand can bind to that protein. Moreover, a ligand binds only to a dedicated area on the surface of the protein, known as the...
Amino acids
Acid Halides to Amides: Aminolysis
In the first step of the aminolysis mechanism, the amine attacks the carbonyl carbon of the acyl chloride to form a tetrahedral intermediate. In the second step, the carbonyl group is re-formed with the elimination of a chloride...
Amides to Carboxylic Acids: Hydrolysis
Acid-catalyzed hydrolysis:
Hydrolysis of amides under acidic conditions yields carboxylic acids. Since the reaction occurs slowly, hydrolysis requires the conditions of heat.
The mechanism begins with the protonation of the carbonyl oxygen by the acid catalyst. The protonation makes the amide carbonyl carbon more...
Basicity of Aliphatic Amines
To measure the basicity of amines, two conventions are generally used. The first defines Kb as the basicity constant for the deprotonation reaction of water by the amine, as presented in Figure 1. Conventionally, lower Kb indicates...
α-Alkylation of Ketones via Enolate Ions
