2500の食品メタゲノムからの未知の微生物多様性とヒトの微生物群との関連
Niccolò Carlino1, Aitor Blanco-Míguez1, Michal Punčochář1
1Department of Cellular, Computational and Integrative Biology, University of Trento, Trento, Italy.
Cell
|August 30, 2024
まとめ
食品メタゲノミクデータ (cFMD) 資源は,食品における微生物の多様性を明らかにしています. これらの食物微生物はヒトの腸内微生物群に寄与し,その一部は食物から腸内に移行する可能性があります.
科学分野:
- 微生物学
- メタゲノミクス
- 食品科学
背景:
- 食品には複雑な微生物群があり 人間の腸内微生物群に影響します
- これらの食品の微生物群の多様性と影響は十分に理解されていません.
研究 の 目的:
- 食品メタゲノムデータの包括的なリソースを作成します.
- 食品内の微生物の多様性を調査する
- ヒトの腸内微生物への 食品微生物の寄与を調査する
主な方法:
- 新しく配列化された1,950種と 583種の公共食品メタゲノムを統合した.
- 食品サンプルから10,899個のメタゲノムアセンブリドゲノム (MAGs) を生成した.
- 人間のメタゲノム>20,000に対してMAGを分析した.
主要な成果:
- キュレーションされたFoodMetagenomicData (cFMD) リソースには,320の新規分類を含む10,899のMAGが含まれています.
- 重要な微生物多様性が食品のカテゴリー内および食品のカテゴリー間で見られた.
- 食品微生物は成人ヒトの腸内微生物群の 約3%を占めています
- 特定微生物種の食物から腸への潜在的感染と植民を特定した.
結論:
- cFMDのリソースは,食品の微生物群に関する知識を大幅に拡張します.
- 食品の微生物群は 人間の腸内微生物群の形成に 役割を果たします
- メタゲノミクスは食品の品質,安全性,認証に適用できます.
