希少なサンプルにおける細胞表面タンパク質に対するDNAアプタマーの発見のための効率的な戦略

科学分野:

• バイオテクノロジー
• 分子生物学
• 診断方法

背景:

• アプタマーは,診断と治療における細胞表面タンパク質の分子認識用プローブです.
• 稀少なサンプルから,少量のタンパク質に対してアプタマーを in situ で選択することは大きな課題です.

研究 の 目的:

• アプタマー発見の限界を克服するために,単一ラウンドの単細胞アプタマー選択法 (DiDS選択) を提示する.
• 細胞表面タンパク質を標的にするアプタマーの識別を,幅広い表現レベルで可能にする.

主な方法:

• 単一ラウンドの単細胞アプタマー選択戦略であるデジタルDNAシーケンシング (DiDS) を開発した.
• PCR増幅バイアスを軽減するためにDNAテンプレートごとに分子識別カードを組み込みました.
• 細胞系,臨床標本,ニューロンにDiDS選択を適用した.

主要な成果:

• DiDS選択を用いた様々な細胞タイプと臨床サンプルに対して,高品質のアプタマーを成功裏に生成した.
• DiDSで選択されたアプタマーは,多量の標的を好む複数のラウンドの選択とは異なり,多量のレベルを持つタンパク質を認識しました.
• 単細胞レベルの細胞表面プロファイリングは,強化されたアプタマープールを使用して,各細胞系にユニークな分子パターンを明らかにしました.

結論:

• DiDS選択は,細胞表面タンパク質を標的とした特定の認識分子の急速な生成のための簡素化されたアプローチです.
• この方法は細胞のプロファイリング,特定の探査機の識別,およびバイオマーカーの発見に期待されます.
• アプタマーの選択を低濃度標的に対して可能にし,精密医療における応用を拡大する.