アフリカのヒト腸内微生物のアトラスを拡張する

科学分野:

• 微生物群の研究
• 集団遺伝学
• 感染症の疫学

背景:

• 腸内微生物の研究は 健康を理解するために不可欠ですが 低所得国や中所得国の代表は不足しています
• AWI-Gen 2 マイクロバイオームプロジェクトは アフリカの多様な集団を研究することで このギャップを埋めています

研究 の 目的:

• アフリカの女性の腸内微生物の構成と 地理,生活様式,臨床的要因との関連を調査する.
• ライフスタイルの変化とHIV感染に関連した新しい微生物のサインを特定する.

主な方法:

• ブルキナ・ファソ,ガーナ,ケニア,南アフリカ出身の1801人の女性を対象とした横断的な研究.
• ショットガンのメタゲノム解析で 腸内メタゲノムを分析する
• 臨床バイオマーカーと人口データを統合する.

主要な成果:

• トレポネマとクリプトバクテロイドが減少し,ビフィドバクテリウムが増加した都市部の人口で,地理的およびライフスタイルに関連した分類を特定した.
• バクテリアのメタゲノム組成型ゲノムを1005個発見しました
• 都市部でのTreponema succinifaciensの欠如を促す可能性のある抗生物質の感受性を発見しました.
• Dysosmobacter welbionisとEnterocloster spを含む新しいHIV感染のサインが特定されました.

結論:

• これはアフリカ人における腸内メタゲノムの 最大規模の調査です
• この発見は,アフリカの様々な環境や生活様式に関連した 微生物群の有意な変化を強調しています.
• この研究は,HIV感染との関連を含む,将来の微生物に関する発見のための豊富なデータセットを提供します.