マウスの視覚皮質における予測されたSstトランスクリプトミックのコネクトミクス

科学分野:

• 神経科学
• 細胞生物学
• コンピュータ生物学

背景:

• 神経回路の機能は 細胞の種類とその接続に依存します
• 細胞タイプ (形態学,電気生理学,トランスクリプトミクス,接続性) を定義するための既存の方法は,しばしばモダリティ特有である.
• パッチセクと電子顕微鏡 (EM) は補完的なデータを提供しますが,統合することは困難です.

研究 の 目的:

• パッチ・セクからの形態学的データを 大規模なEMデータセットと統合する.
• 形質学を用いて,トランスクリプトミカルで定義された抑制性ニューロンタイプを予測する.
• マルティノッティ細胞などの特定の細胞の結合パターンを調査する.

主な方法:

• パッチ・セクからの形態学的データを活用して,EMデータにおける細胞サブクラスと形態電気転写体 (MET) 型を予測した.
• 分析されたマーティノッティ細胞 (ソマトスタチン陽性) をMETタイプに分類する.
• トランスクリプトミックのアイデンティティとシナプス接続性の相関する形態学的特徴.

主要な成果:

• EM形態から阻害性ニューロンのトランスクリプトミックの細胞型を成功裏に予測した.
• 異なる軸索ミエリン化とシナプス出力を持つSST MET型にマーティノッティ細胞を分類した.
• 形態学が実験方法の細胞タイプを結びつけることを示した.

結論:

• 形態学的特徴は,細胞型の定義のための異なる実験技術間のギャップを埋めることができます.
• この統合は,遺伝子発現と電気生理学の接続性を比較することを可能にします.
• 予測されるソマトスタチンの細胞タイプは,独自の接続性ルールが特定されました.