Perturb-Multimodal: 完ぺきな哺乳類の組織で画像と配列を組み合わせた遺伝子スクリーニングのプラットフォーム

科学分野:

• 細胞・分子生物学
• 遺伝学
• システム生物学

背景:

• メタゾウの生命は様々な細胞の間の 調整された遺伝子活動に依存している.
• 組織機能を理解するには,細胞と組織のフェノタイプを in vivo 遺伝的に制御することを解剖する必要があります.

研究 の 目的:

• パートルブ・マルチモダル (Perturb-Multi) という新しいペアリング画像とシーケンシングの方法を紹介します.
• 集団的な遺伝的混乱を用いて組織内の多様式遺伝子型-フェノタイプマップを大規模に構築する.

主な方法:

• Perturb-Multiは,個々の細胞の混乱識別,遺伝子発現プロファイリング,および細胞下形態測定のためのイメージングを統合しています.
• 単細胞の同時配列化は 遺伝的混乱に対する完全なトランスクリプトミックの反応を捉えます
• マウスの肝臓組織に何百もの遺伝的変異を 適用した.

主要な成果:

• この研究では,肝細胞の区分を制御する遺伝的調節因子とメカニズムが特定されました.
• 肝臓細胞のタンパク質反応の 遺伝的制御を明らかにした
• ステアトーシスの遺伝的基盤は,このマルチモダルのアプローチを用いて調査されました.

結論:

• Perturb- Multimodal (Perturb- Multi) は,複雑な細胞および組織生理学の遺伝的基礎の発見を大幅に加速します.
• 生成されたデータは,細胞機能の機械学習モデルのための重要なトレーニングデータセットとして機能します.