Porphyromonas gingivalisのチロシンフォスファタゼによって制御されるトランスクリプション・レギュロン

科学分野:

• 微生物学
• バクテリアの翻訳後の変化
• トランスクリプトミクス

背景:

• タイロシン酸化/脱酸化 (PTM) は,細菌のタンパク質の機能と位置を調節する.
• バクテリアの遺伝子発現に影響を与える.
• バクテリアのトランスクリプトームに対するチロシン・フォスファタゼの全体的な影響はほとんど知られていない.

研究 の 目的:

• 主要なチロシン・ファスファタゼ Ltp1 と Php1 が Porphyromonas gingivalis のトランスクリプトームに及ぼす全体的な影響を調査する.
• 野生型と変異株のインビトロとインビボの転写プロフィールを比較する.
• 細菌の適応と遺伝子調節における Ltp1 と Php1 の役割を解明する.

主な方法:

• RNAシーケンシング (RNA-Seq) は,ポルフィロモナスの野生型 (WT),Δltp1,およびΔphp1変異株で行われました.
• 菌株はインビトロおよびインビボ (マウス) の条件下で培養され,試験された.
• DEGを特定するために,差異的遺伝子発現分析が行われました.

主要な成果:

• In vitroでは,Δltp1とΔphp1の突然変異は,WTと比較して最小の転写差を示した.
• vivoでは,Δphp1変異体はトランスポーターシステムに関連したDEGを示した.
• In vivoでは,Δltp1変異体は,ゲノム安定とΔphp1との共有トランスポーターシステムの調節に関与するDEGを示した.
• WT菌株は,in vitroと比較して,in vivoでDNA代謝過程 (再結合,転置) の調節を向上させました.

結論:

• Ltp1は,転写レベルでの細菌のインビボ環境への適応において重要な役割を果たします.
• Ltp1とPhp1は,トランスポーター系遺伝子の発現を調節する共通の機能を共有しています.
• タイロシンフォスファタゼは,特に宿主との相互作用中に,細菌の遺伝子発現の重要な調節剤である.