トランスクリプトームの配列解析は,2つの関連種の進化史と遺伝子発現の進化を明らかにする

科学分野:

• 海洋生物学
• 進化 的 な 遺伝子
• 分子生物学

背景:

• パガルス・ラヌギノスとパガルス・マキュルスとは密接な関係がある.
• 以前は 色が変化すると考えられていたが 最近の研究では 色が変化する特徴が 明らかになった.

研究 の 目的:

• P. lanuginosus と P. maculosus の分岐後の分子と遺伝子発現の進化を調査する.
• この2種のエレミット・カニの形態学的違いの遺伝的根拠を理解する.

主な方法:

• トランスクリプトームの配列化とデノボトランスクリプトームの組み立てを頭胸とペレオポッドの組織で実施した.
• 同義詞と非同義詞の差分を推定する.
• 分岐時間を決定する 系統遺伝分析を行った.
• 種と組織間の遺伝子発現パターンを比較した.

主要な成果:

• ゲノム解析では 約624万年前の分岐を示しています
• 同義詞と非同義詞の差異率はそれぞれ0. 0246と0. 0066でした.
• タンパク質をコードするトランスクリプトの約5%は,陽性選択のサインを示した.
• P. maculosusは細胞外マトリックスとキチン関連遺伝子のアップレギュレーションを示し,P. lanuginosusは色素遺伝子のアップレギュレーションを示した.

結論:

• この研究は,P. lanuginosusとP. maculosusの分子進化史を明らかにしている.
• 足の組織における遺伝子発現の差異は,これらのエリミット・カニの形態学的区別に寄与する.
• 発見は,ピグメンテーションと細胞外マトリックスを含む特定の遺伝子セットが,種多様化を推進する役割を強調しています.