中国ハムスターの卵巣細胞のゲノムスケールのCRISPR削除画面は,コード化および非コード化ゲノムの重要な領域を明らかにします

科学分野:

• 細胞生物学
• ゲノミクス
• バイオテクノロジー

背景:

• 中国ハムスター卵巣 (CHO) 細胞はバイオ医薬品の生産に不可欠です.
• 遺伝子工学の取り組みは,主にコードする遺伝子に集中し,広大なコードしないゲノムを無視しています.
• CHO細胞の機能を最適化するために,非コーディングゲノムを理解することが不可欠です.

研究 の 目的:

• CHO細胞ゲノムの注釈されていない領域の本質を体系的に調査する.
• CHO細胞生存とフェノタイプにとって重要なゲノム要素を特定する.
• 生物処理における遺伝子工学の新たなターゲットを探求する.

主な方法:

• ゲノムスケールのCRISPRスクリーニングプラットフォームを用いて 150kbのゲノムセクションを削除しました
• 死亡する細胞を検知して 重要な領域を特定するために ネガティブスクリーンを実行しました
• アノテーション状態,転写活動,クロマチンの状態を評価することによって,重要な領域を特徴づけました.

主要な成果:

• CHO細胞で 427 の重要なゲノム領域が特定され,その多くは現在の注釈や既知の機能が欠けています.
• いくつかの重要な領域の削除が致命的であることが示され,重要な規制の役割を示しています.
• アノテーションステータス,トランスクリプション活動,および識別された重要な領域のクロマチン状態を提供した.

結論:

• CHO細胞のゲノムの一部は,以前は
• ダークマター
• 細胞の生存に 重要な役割を果たします
• これらの重要な非コード領域には重要な規制機能があります.
• これらの領域のゲノム全体の理解は,生物処理のためのCHO細胞工学を前進させることができます.