ターゲットペア:がん治療のための臨床試験由来の治療標的組合せの単細胞オミクスリソース

科学分野:

• 腫瘍学
• バイオ情報学
• コンピュータ生物学

背景:

• 腫瘍の微小環境 (TME) は,がん治療に重大な課題をもたらします.
• マルチターゲティング戦略は臨床的に有望ですが,しばしば経験的方法に依存しています.
• 多標的治療のための標的ペアの合理的な設計は優先事項です.

研究 の 目的:

• 臨床的に重要な癌のTPとその単細胞特性に関する包括的なデータの欠如に対処する.
• オミックスの特徴を持つ手動で注釈されたTPのデータベースを確立する.
• 多標的がん治療の合理的な設計を容易にする

主な方法:

• 抗腫瘍効果が評価された薬剤の組み合わせとマルチターゲティング薬のTPのマニュアル・アノテーション
• 同発現,分布,細胞分子を含むTPの単細胞オミクス特性の計算.
• 55の出版物から単細胞RNAシーケンシング (scRNA-seq) データセットのキュレーション.

主要な成果:

• TargetPairのデータベースには,承認された60人,臨床段階の1,580人,実験段階の7,424人の臨床医が含まれています.
• 3470件の臨床試験と1396件の出版物から,TPが注釈された.
• Omicsの特徴は,13種類の細胞,16種類の癌,そして588人の患者から3,022,556個の単細胞から得られた.

結論:

• TargetPairデータベースは,単細胞レベルでTPを理解するための貴重なリソースを提供します.
• このリソースは,新しい多標的がん治療の合理的な設計に役立ちます.
• データベースは,研究目的でオンラインで自由にアクセスできます.