トーティ:トーティポテント幹細胞における遺伝子発現の表遺伝的調節を解読するための統合されたマルチオミックデータベース
Yi Chai1, Ruiying Zhang2, Shunze Jia2
1Department of Nephrology, Children's Hospital, Zhejiang University School of Medicine, National Clinical Research Center for Child Health, Hangzhou, Zhejiang 310052, China; Liangzhu Laboratory, Zhejiang University, 1369 West Wenyi Road, Hangzhou, Zhejiang 311121, China; Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou, Zhejiang 310058, China; Yong Loo Lin School of Medicine, National University of Singapore, 10 Medical Dr, Singapore 117597, Singapore.
トティポテント幹細胞 (TSC) は早期発育に不可欠ですが,包括的なデータが不足しています. 新しいTotiデータベースは,TSCとその分子メカニズムを探索するために8,284個のサンプルのためのマルチオミックデータを提供します.
科学分野:
- 発達生物学
- ゲノミクス
- エピジェネティクス
背景:
- トティポテンツ幹細胞 (TSC) は哺乳類の胚形成の基礎であり,広範な分化能力を持っています.
- 既存の胚のデータベースには,トーティポテンシーに関する重要なエピジェネティックとトランスクリプトミックのデータが欠けていて,その確立と退出に関する研究が妨げられています.
- 発育生物学と再生医療にとって,トーティポテンシーメカニズムを理解することは不可欠です.
研究 の 目的:
- トーティを紹介します トーティにフォーカスした新しいマルチオミクスデータベースです
- 様々なTSCモデルと初期胚に対して,包括的なトランスクリプトミクスとエピジェネティックリソースを提供すること.
- トーティポテンシーを制御する分子因子に関する研究を容易にする.
主な方法:
- 8,284個のサンプルから集積されたマルチオミクスデータ (トランスクリプトミクスとエピジェネティック).
- ヒトとマウスのTSC,TSCのような細胞,多能性幹細胞,植入前の胚など,様々な種類の細胞が含まれています.
- データ探査のための検索,ブラウズ,分析モジュールを開発した.
主要な成果:
- トーティはトーティポテンシを調査するための集中的なリソースを提供します.
- このデータベースは,トランスクリプトミクスとエピジェネティックの特徴を比較的に可視化します.
- モチーフと経路の濃縮分析と単細胞解像度研究をサポートします.
結論:
- トーティは,トーティポテンシーの分子基盤を探求するための先駆的なリソースです.
- TSCのエピジェネティックとトランスクリプトミックのデータにおける重大なギャップを解決します.
- 早期哺乳類の発達と 幹細胞生物学に関する理解を深めるでしょう
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