薬の情報抽出は,ローカルな大型言語モデルを用いて行われます
Phillip Richter-Pechanski1, Marvin Seiferling2, Christina Kiriakou3
1Section of Bioinformatics and Systems Cardiology, Klaus Tschira Institute for Integrative Computational Cardiology, Im Neuenheimer Feld 669, 69120 Heidelberg, DE, Germany; Department of Internal Medicine III, University Hospital, Im Neuenheimer Feld 410, 69120 Heidelberg, DE, Germany; German Center for Cardiovascular Research (DZHK) - Partner site Heidelberg/Mannheim, Im Neuenheimer Feld 669, 69120 Heidelberg, DE, Germany; Informatics for Life, Im Neuenheimer Feld 669, 69120 Heidelberg, DE, Germany; Department of Computational Linguistics, Heidelberg University, Im Neuenheimer Feld 325, 69120 Heidelberg, DE, Germany.
精密調整されたローカル・ラッグ・ランゲージ・モデル (LLM) は,臨床テキストから最先端の薬物抽出を実現し,正確性と透明性を向上させます. これらのモデルは現実の医療環境で 効率的で信頼性の高いソリューションを提供します
科学分野:
- 医療情報学
- 自然言語処理
- 人工知能
背景:
- 構造化されていない臨床テキストから薬剤情報を抽出することは不可欠ですが,手作業とエラーのために困難です.
- 現在の自動化方法は,専門知識の要求,時間制限,ITインフラストラクチャ,透明性などの制約に直面しています.
- ゲネラティブ・ラッグ・ランゲージ・モデル (LLM) とパラメータ効率的な微調整は,有望な解決策を提供します.
研究 の 目的:
- 自動化されたエンドツーエンドの医薬品情報抽出のためのローカルLLMを評価する.
- 英語とドイツ語の臨床データセットの両方で微調整されたLLMのパフォーマンスを評価する.
- 予測の透明性を高めるために,説明可能なテクニックを使用します.
主な方法:
- 地元のLLMで命名されたエンティティ認識と関係抽出を使用しました.
- 形式制限の指示と評価のための自動フィードバックパイプラインを使用します.
- トークンレベルのシャプリー値を適用して,トークンの貢献を視覚化および定量化します.
主要な成果:
- 精密調整されたラマモデルは,英語のデータで新しい最先端の結果を出し,F1スコアを最大10pp改善しました. 薬剤による副作用と6 pp. 薬の理由から
- Llamaはドイツのデータセットで新しいベンチマークを確立し,従来の方法を最大16pp上回りました. マイクロ平均F1スコア
- OpenBioLLMは 構造化された出力の限界と 幻覚を経験した.
結論:
- 薬の情報を抽出するための 最先端の方法を超えています
- これらのモデルは,英語とドイツ語の両方で有効な臨床環境で,限られたリソースで高性能を提供します.
- シェープリー値は予測の透明性を高め,臨床意思決定を支援します.
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