リンパ節転移に関連した微生物群の特徴

科学分野:

• 腫瘍学
• 微生物学
• ゲノミクス

背景:

• リンパ節 (LN) 転移は喉頭状細胞癌 (LSCC) の重要な予後要因である.
• 癌の進行における微生物群の役割は 新興の研究分野です
• 病原菌と転移の関連性を理解することで,患者の分層化と治療戦略に役立ちます.

研究 の 目的:

• LSCCにおけるリンパ節転移に関連した微生物の特徴を調査する.
• 転移状態に基づくLSCC患者の分層化のためのこれらの微生物シグネチャーの可能性を調査する.
• 隠されたリンパ節転移の非侵襲的なバイオマーカーとしての口腔微生物群の有用性を評価する.

主な方法:

• 腫瘍組織,隣接する正常組織,リンパ節,および108人のLSCC患者 (36 LN+, 72 LN-) の口腔洗浄の微生物群をプロファイルするために16S rRNA遺伝子シーケンスを使用した.
• PICRUSt2を用いて微生物の機能的可能性を予測した.
• 層別クロス検証に基づくランダムな森林モデルを使用して,転移に関連する微生物の属性を特定しました.

主要な成果:

• LN+とLN- LSCCの腫瘍組織の微生物組成の有意な違いが観察され,RalstoniaはLN+に富み,LN-の場合はFusobacteriumであった.
• LN+患者における機能的予測は,特に腫瘍と口腔洗浄のサンプルにおける,脂質生物合成,エネルギー代謝,細胞壁合成経路の強化を示した.
• 腫瘍,リンパ節,および口腔の微生物群に構築された分類器は,LN+とLN-患者の区別において有意な精度を示し,リンパ節分類器は84. 31%の精度を達成しました.

結論:

• 微生物群の変化はLSCCにおけるリンパ節転移と関連しています.
• 口腔の微生物群は,隠されたリンパ節転移を検出するための非侵襲的なバイオマーカーとして潜在的に持っています.
• これらの予備的な発見を確認するために,より大きなコホートでのさらなる検証が必要である.