ウェールズにおけるMycobacterium tuberculosisのゲノム流行病学

科学分野:

• ゲノム流行病学
• 感染症の監視
• 公衆衛生の微生物学

背景:

• 結核の伝播を促す要因を特定することは,効果的な公衆衛生の介入に不可欠です.
• 結核のゲノム群集に関する以前の研究は,関連因子に関する矛盾した結果をもたらしました.
• Mycobacterium tuberculosisの菌株の多様性と薬剤耐性パターンを理解することは 結核の蔓延を制御する上で鍵となるものです

研究 の 目的:

• ウェールズにおける Mycobacterium tuberculosis 菌株の多様性,耐薬性,感染パターンを分析する.
• ウェールズにおける結核症例の遺伝子型クラスタリングに関連する要因を特定する.
• ターゲットを絞った結核予防と予防戦略を策定する.

主な方法:

• シングル・ヌクレオチド・ポリモルフィズム (SNP) ベースのタイプ化を使用して,Mycobacterium tuberculosisの単離物の系統とクラスタを推論した.
• 結核コホートデータ (2012年-2022年) と,国家結核監視システムからの患者レベルのデータを統合した.
• 記述的疫学とロジスティック回帰モデリングを使用して,遺伝子型クラスタリングに関連する要因を特定しました.

主要な成果:

• 215人の結核症例を分析し,そのうち115人は30のゲノム群 (系統2〜4) に属し,主に南ウェールズで発生した.
• 一般的なウェールズ人と比較して,民族,年齢,貧困 (ウェールズ多重貧困指数 - WIMD) で著しい差異が観察されました.
• 薬剤耐性の割合は低かった.イギリス生まれの地位と肺疾患は,ゲノムクラスタリングの確率の増加と関連していた.

結論:

• ゲノムによる結核のクラスタリングは 特定の人口統計的および臨床的要因と関連しており, イギリスで生まれ,肺疾患を患っていることも含まれます.
• 集団化された症例における民族性,年齢,社会経済的地位の違い (WIMDクインティール) は,標的のスクリーニングアプローチを示唆する.
• 将来の研究は,ゲノムクラスターで特定された集団に対する強化された制御措置を評価すべきである.