デイノコックス・リチェニコラ sp. nov. 液体のサンプルから分離した細菌
Guo-Hua Chen1, Lian-Shuang Xiong1, Rui Yang1
1The Key Lab for Research & Development of Actinomycete Resources, Yunnan Institute of Microbiology, Chenggong Campus of Yunnan University, Chenggong District, Kunming, 650500, Yunnan, China.
新しいバクテリア,Deinococcus lichenicola sp. リンゴから分離された. このグラム陽性菌は Deinococcus属の新種で 微生物の多様性を拡大しています
科学分野:
- 微生物学
- 細菌学
- タクソノミー
背景:
- 菌類は微生物の多様性を 抱えています
- 細菌の分離と特徴づけは 微生物の生態系を理解するために重要です
研究 の 目的:
- 新種のバクテリアをリッチンから分離し特徴づけること.
- デイノコックスの属内の新種の分類的位置を決定する.
主な方法:
- グラム染色とフェノタイプの特徴付け
- 生理学的成長条件 (温度,pH,塩分) の検査
- 呼吸器キノン分析 細胞脂肪酸プロフィール 極性脂質分析
- 16S rRNA遺伝子の配列を基にした遺伝分析.
- DNA G+C 含有量決定,平均ヌクレオチド同一性 (ANI),デジタルDNA-DNA混合化 (dDDH) について
主要な成果:
- グラム陽性で動かないコッコー型細菌 (YIM 134068T) がリケーンから分離された.
- 隔離物は28°C,pH7.0と0~3.0%のNaClで最適の成長を示し,MK-8は主要な呼吸器キノンである.
- 系統遺伝分析では,Deinococcus aetherius ST0316T (93. 2%) と最も高い16S rRNA遺伝子の類似性を示した.
- DNAのG+C含有量は69.1%で,ANIとdDDH値はそれぞれ82.6~83.0%と26.3~26.7%で,関連種と異なる.
結論:
- 株 YIM 134068TはDeinococcus属の新種である.
- この新種の名称は Deinococcus lichenicola sp と提案されている. ノブ
- この発見は,Deinococcus属とリケンの関連細菌の分類学的な知識に寄与しています.
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