再発性アクロモバクターの血流感染症患者におけるゲノム異質性および系統特有のベータ・ラクタメーゼ

科学分野:

• 微生物学
• ゲノミクス
• 感染症

背景:

• アクロモバクテルの再発は,抗菌剤耐性および患者の進化により,臨床的な課題を提示します.
• 効果的な治療には,耐性メカニズムの正確な識別と理解が不可欠です.

研究 の 目的:

• 繰り返し感染したアクロモバクテルの遺伝子およびフェノタイプの変化を全ゲノム配列化を用いて調べる.
• 種を特定し,抗菌剤耐性パターンを検出する.

主な方法:

• 65人のアクロモバクター感染症例 (2016-2023) の遡及分析
• 繰り返し発生する血流感染症の 12 個の単離物の全ゲノム配列解析 (オックスフォードナノポール).
• 平均ヌクレオチド同一性 (ANI) を用いた抵抗性遺伝子,ベータ・ラクトマゼの特定と系統遺伝分析.

主要な成果:

• 再発性感染症は,血流および尿路感染症と関連していた (p<0. 01).
• 全ゲノム配列解析により,新しいアクロモバクテルの種と,MALDI-TOF MSを上回るA. insuavisの最初のバクテレミア症例が特定されました.
• ベータ・ラクタマースの分布は,系統特有の耐性を示す,系統特有のクラードと相関している. 特定の遺伝子 (siaT,rapA,atzEa1,AL523_09115,clpA) のミッセンスの変異は,抗菌剤耐性変化と関連していた.

結論:

• 全ゲノムシーケンシングはアクロモバクテルの種識別と抗菌剤耐性の検出を強化します.
• 遺伝的異質性や in vivo 進化は再発性感染症に寄与する.
• 変種とその臨床的影響をモニタリングするために,さらなる大規模な研究が必要である.