培養されていない微生物の大部分を培養する
Michaela M Salcher1, Paul Layoun2,3, Clafy Fernandes2,3
1Institute of Hydrobiology, Biology Centre CAS, Ceske Budejovice, Czech Republic. michaelasalcher@gmail.com.
研究 者 たち は 中央 ヨーロッパ の 湖 から,これまで 培養 さ れ て い なかっ た 水 の 微生物 の 627 種 を 培養 し た. このコレクションは,豊富で成長が遅いオリゴトロフを含むことで,微生物の生態学と進化の理解を大幅に高めています.
科学分野:
- 微生物学
- エコロジー
- ゲノミクス
背景:
- アクセニック培養は微生物の研究に不可欠ですが,公共のコレクションには多くの水生微生物が欠けています.
- オリゴトロフな生活様式と特徴のない成長需要は多くのプロカリオットの栽培を妨げます.
研究 の 目的:
- 以前培養されていない 豊富な淡水生殖生物を培養する
- 微生物培養コレクションを自然水生環境に関連する菌株で拡張する.
主な方法:
- ハイ・スループット・ディルクション・トゥ・エクスティンクション・カルチャー
- 自然のオリゴトロフィック条件を模倣した定義されたメディアを使用します.
- 中欧の14の湖からサンプルを採取した.
主要な成果:
- 豊富な淡水バクテリアの最大72%を代表する15の属を含む627のアクセン菌株が得られました.
- 培養株は,新しい分類種を含むメタゲノムアセンブリドゲノム (MAG) と密接に関連しています.
- これらの豊富な微生物の様々な代謝経路とライフスタイルの特徴です.
結論:
- このイニシアチブにより"未培養の微生物の多数"が栽培され,生態学の研究に貴重な資源となった.
- このコレクションは,微生物の生態学と進化の研究を進めるための新しいオリゴトロフモデル生物を提供します.
- いくつかの新しい家族,属,種の分類を提案し,公共のリポジトリを豊かにしました.
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