フォーマリン固定型パラフィン埋め込まれた臨床サンプルにおける空間性脂質学のためのMALDI-MSIマトリックスとしての6-アザ-2-チオチミンの研究
Natalia Shelly Porto1, Simone Serrao1, Greta Bindi1
1Department of Medicine and Surgery, Proteomics and Metabolomics Unit, University of Milano-Bicocca, 20854 Vedano al Lambro, Italy.
この研究では,6-アザ-2-チオチミン (ATT) が,フォーマルリン固定型パラフィン埋め込み (FFPE) 組織における脂質のマトリックスアシストレーザー分解/イオン化質量スペクトロメトリ画像 (MALDI-MSI) の有効なマトリックスであることを示した. ATTは臨床サンプルにおける詳細な脂質マッピングを可能にし,疾患の研究を支援します.
科学分野:
- バイオメディカル・マススペクトロメトリー
- リピドミクス
- 分子病理学
背景:
- 脂質は病気の発生,進行,結果において重要な役割を果たします.
- マトリックス・アシスト・レーザー・デソルプション/イオニゼーション・マス・スペクトロメトリ・イマージング (MALDI-MSI) は,組織から直接空間的に分解された脂質プロファイリングを可能にします.
- 効果的なMALDIマトリックス選択は,フォーマルリン固定パラフィン埋め込まれた (FFPE) 組織のような挑戦的な標本における敏感な脂質分析に不可欠です.
研究 の 目的:
- FFPEの臨床サンプルにおける脂質のMALDI-MSIのマトリックスとして6-アザ-2-チオチミン (ATT) を評価する.
- ATTの性能を確立されたマトリックス (DHB,NOR) と比較する.
- 脂質プロファイルに基づいて正常組織と癌組織を区別するATTの有用性を評価する.
主な方法:
- 脂質基準のATT,DHB,NORの比較分析
- プラスとネガティブなイオンモードでATTを使用して,FFPE脳部分の脂質のMALDI-MSI分析.
- 組織病理学的な相関性のために,FFPE膠芽細胞組織マイクロアレイ (TMA) にATTを適用する.
主要な成果:
- ATTは,FFPEの脳部分における98の脂質の推定アノテーションを可能にし,グリセロフォスフォリピッドとスフィンゴリピッドのバランスの取れた検出を可能にしました.
- ATTは,グリコリピドと脂肪酸の識別においてDHBとNORを上回り,DHBと比較して優れた脂質クラスの多様性を示した.
- ATTは,FFPEのサンプルで,正常な脳組織とグリオブラストーマを区別できる脂質特性を成功裏に明らかにしました.
結論:
- ATTは,高側解像度 (20 μm) でさえも,病理学における脂質学的MALDI-MSIアプリケーションに適したマトリックスです.
- ATTの使用は,同じ組織部からの脂質とペプチドの両方の分析を可能にするため,マルチオミックスの研究に戦略的利点を提供します.
- ATTはポジティブとネガティブのイオン化モードの両方でリピドミック分析をサポートし,FFPE組織分析におけるその汎用性を高めます.
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