多剤耐性OXA-48を生成するST135のゲノムに関する洞察

科学分野:

• 微生物学
• ゲノミクス
• 抗菌剤に対する耐性

背景:

• OXA-48のようなカルバペネマースを生成する腸内細菌は,世界的に健康上の懸念が高まっている.
• OXA-48のようなカルバペネマスを宿すプロテウス・ミラビリス菌株は,まれに報告されています.
• このような株の特徴は,その流行病学と拡散を理解するために不可欠です.

研究 の 目的:

• ギリシャのOXA-48のようなカルバペネメーゼ生成型プロテウス・ミラビリス菌株 (Pm GR-1) の特徴を特定する.
• 他の知られているOXA-48のようなカルバペネメーゼ生成株との比較遺伝子解析を行う.
• 特定された菌株の遺伝的関連性,抗菌剤耐性,ウイルス性因子を評価する.

主な方法:

• Vitek® コンパクトおよび質量スペクトロメトリを用いた現象型および生化学的特徴づけ.
• 抗菌感受性検査とベータ・ラクタマース検出
• マルチロカス配列型化 (MLST) と全ゲノム配列化 (WGS)
• モバイル遺伝子要素 (MGE),ゲノムアイランド (GI),抗菌剤耐性遺伝子 (ARG),ウイルス性因子 (VF) のシリコ分析.
• 系統遺伝学,コアゲノムSNP,および比較ゲノム分析

主要な成果:

• ギリシャの病院の外科患者の尿サンプルから分離されたPm GR-1菌株は,アミカシンとセフタジドーム/アビバクタムにのみ耐性を示した.
• それは,キノロン抵抗性変異と共に,複数のベータ-ラクタマース遺伝子 (blaOXA-48, blaCTX-M-14, blaTEM-1, blaTEM-2) と他のARGを宿していた.
• この菌株は国際的なクローンST135に属し,ドイツと米国のOXA-48を生成するP.ミラビリス菌株と遺伝的類似性を示し,重要な遺伝的構造と毒性の要因を共有している.

結論:

• この研究は,ギリシャでblaOXA-48を持つプロテウス・ミラビリス菌株の最初の報告です.
• 異なる地域における国際クローンST135のP. mirabilis株におけるblaOXA-48の発生と拡散は,公衆衛生上の重大な懸念事項である.
• "ワンヘルス"の枠組みの中でこれらの株の継続的な監視は,その影響を軽減するために不可欠です.