16S rRNA分析と機能的予測による野生と捕獲されたエピネフェルス・モリオの腸内微生物の構成と構造
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まとめ
この要約は機械生成です。レッドグルーパー (Epinephelus morio) の腸内微生物は,野生の魚と飼育されている魚の間で異なっています. 捕虜状態は 水質汚染などの環境要因により 腸内微生物の多様性を減少させます
科学分野
- 海の微生物学
- 魚の腸内微生物群
- メタゲノミクス
背景
- 腸内微生物群は 宿主の代謝に不可欠であり 生物学的および環境的要因の影響を受けます
- 魚の腸内微生物群を理解することは 養殖と野生の魚群の健康に不可欠です
研究 の 目的
- 腸内微生物の組成と構造を野生と飼育中の赤 (Epinephelus morio) で特徴づけること.
- 赤毛の腸内微生物の 代謝機能を予測する
- 共有された核微生物群と 潜在的に独占的な集団の仮説を検証する.
主な方法
- 野生と飼育中の赤の腸内部のDNA抽出
- 16S rRNA遺伝子増幅とシーケンシング (Illuminaペアエンド技術).
- QIIME2パイプラインを用いた生物情報分析による多様性の評価
- PICRUStを用いた代謝機能推論
主要な成果
- 29の属が特定され, Pseudomonadota, Bacillota, Fusobacteriota, Actinomycetota が最も豊富である.
- 主要な属にはフォトバクテリア,ビブリオ,セトバクテリア,エシェリキア・シゲラが含まれていた.
- 消化,免疫,抗酸化酵素,抗生物質耐性,ビタミンB12輸送に関連する予測された機能.
結論
- エピネフェルス・モリオの腸内微生物群は,特定の支配的な属と属で構成されています.
- 予測された微生物の機能は宿主の代謝,免疫,栄養素の輸送をサポートします.
- 捕獲された赤毛の微生物群は環境の変化に敏感で 水の汚染によって多様性が低下する可能性があります
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