トランスクリプトーム分析により,ウサギの筋肉内脂肪の蓄積を支える重要な遺伝子と規制ネットワークが明らかになった

科学分野:

• 動物科学
• ゲノミクス
• 肉科学

背景:

• 筋肉内脂肪 (IMF) は,うさぎの肉の質に大きく影響し,柔らかさ,汁性,味に影響します.
• ウサギの肉の特性を高めるには IMF 沈着の理解が不可欠です.
• この研究はハイコールとレックスウサギのロングシマス・ドルシ (LD) 筋肉に焦点を当てています.

研究 の 目的:

• ハイコールとレックスウサギの成長,屠殺性能,肉の品質の特徴を評価する.
• IMFの内容に影響を与える異なる発現遺伝子 (DE mRNAs) と長い非コーディングRNA (DE lncRNAs) を特定する.
• レックスウサギの脂肪の発達を理解するための lncRNA-mRNA 制御ネットワークを構築する.

主な方法:

• ハイコールとレックスウサギの比較分析
• DE mRNAsとDE lncRNAsを識別するための全トランスクリプトームシーケンシング.
• lncRNA-mRNA制御ネットワークの構築とシグナル伝達経路 (Wnt,TGF-β,PPAR) の濃縮分析
• ショート・シリーズ・エキスプレッション・マイナー (STEM) とウェイトド・ゲン・コエクスプレッション・ネットワーク分析 (WGCNA) の適用

主要な成果:

• レックスウサギはハイコールウサギよりも高いレベルを示した.
• いくつかのDE mRNA (例えば,KCNQ5,POSTN) とDE lncRNAが脂肪の蓄積と関連していることが確認された.
• 濃縮分析は 特定された遺伝子を 重要な脂肪の蓄積経路と関連付けました
• STARD13,HSPB8,CBLBを含む10のlncRNA-mRNA標的遺伝子のペアは,IMF収納の主要な調節因子として特定されました.

結論:

• STARD13,HSPB8,およびCBLBは,ウサギのIMF収納に起因する重要な遺伝子として特定されています.
• ウサギのIMF収納は,有意でダイナミックな転写変化と関連しています.
• 発見は,遺伝的繁殖戦略とウサギの脂肪の発達を理解するための基盤を提供します.