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Updated: Sep 9, 2025

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Published on: December 23, 2022

ナイジェリアの小売肉からEnterococcus faecalisのゲノムと生物情報学的洞察

Charles Ayodeji Osunla^1,2, Ayorinde Akinbobola¹, Arif Elshafea³

¹Department of Microbiology, Adekunle Ajasin University, Akungba Akoko, Nigeria.

International journal of microbiology

|August 29, 2025

まとめ

ナイジェリアの小売肉,特に鶏肉で発見された抗菌剤耐性エンテロコッカス・フェカリスは,公衆衛生上の重大なリスクを強調しています. 全ゲノム配列解析により主要な耐性遺伝子と移動要素が発見され,食品安全監視の強化の必要性が強調された.

科学分野:

微生物学
ゲノミクス
食品の安全性

背景:

Enterococcus faecalisは,抗菌剤耐性 (AMR) と動物性感染症の可能性が増加している重要な機会性病原体です.
食品源におけるE. faecalisのゲノム環境を理解することは公衆衛生にとって極めて重要です.
小売肉は食物媒介の病原菌の潜在的貯蔵庫として機能します

研究の目的:

ナイジェリアの小売肉からのEnterococcus faecalis分離体を全ゲノムシーケンシング (WGS) を使用して特徴づけること.
抗菌剤耐性遺伝子 (ARG),ウイルス性因子,移動性遺伝子要素 (MGE) を特定する.
E. faecalis 単離物の遺伝関係を決定する.

主な方法:

50個の生肉 (鶏肉,牛肉,トルコ肉) のサンプルを採取し,加工した.
回復したE. faecalisの抗菌感受性試験
全ゲノムシーケンシング (WGS) とARG,ウイルス性遺伝子,MGE,および系統学的分析.

主要な成果:

主にニワトリから10種類のE. faecalisが発見され,すべてクリンダミシン,エリトロミシン,テトラサイクリンに対する耐性を示した.
主要なARGは,aac ((6') -aph ((2"),ant ((6) -Ia,lsa ((A),erm ((B),tet ((M),およびtet ((L) を含む.
系統遺伝学的分析により,地理的なクラスタリングによる2つの主要な系統 (ST477,ST16) が特定され,MGEのARGと毒性因子のコロカライゼーションが明らかになった.

結論:

食物媒介のE. faecalisは多剤耐性や毒性の要因を持ち,動物性感染症の危険性がある.
MGEsの存在は,潜在的な水平遺伝子転送を容易にする.
食品システムにおけるゲノム監視とAMRの管理は,特に低所得国や中所得国において不可欠です.

キーワード:

エントロコッカス・フェカリスナイジェリア抗菌剤耐性についてプラズミッド小売肉毒性について全ゲノムシーケンシング

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