MEF2Cは,心臓管形態変異を制御するセグメント特有の遺伝子制御ネットワークを制御する

科学分野:

• 発達生物学
• 遺伝学
• 分子生物学

背景:

• 初期の心臓形成を制御する遺伝子調節ネットワーク (GRNs) は完全に理解されていません.
• 心臓の発達を制御する系統特有のGRNsは,ほとんど定義されていない.

研究 の 目的:

• MEF2C制御のGRNを心臓の発達初期に調査する.
• 系統特有のGRNを定義し,MEF2Cに依存する規制要素を特定する.

主な方法:

• ワイルド型とMef2c-null胚の時間経過単核RNA配列とATAC配列を用いました.
• ディープラーニングモデルを使って 統合されたマルチオミクスデータで 発達軌道を構築する.
• MEF2C依存の増強剤を計算で特定したゼブラ魚の心臓の発達

主要な成果:

• Mef2c-null 胚の心臓の遺伝子シグネチャーとクロマチンのパターンを特定しました
• Mef2c-null 胚の変異を明らかにする心臓段の発達軌道を構築し,分析した.
• 核ホルモン受容体NR2F2の活性が増加していることが判明しました.

結論:

• 早期の心臓管に描かれた系統特有のGRNs.
• 発達の過程における転写ネットワークの解剖のための一般化可能な枠組みを提供した.
• MEF2CとNR2F2が心臓の発達と異常形成における役割を強調した.