イスラエル系ユダヤ人とパレスチナ系アラブ人におけるB細胞非ホジキンリンパ腫サブタイプに関するヨーロッパベースのポリジェニックリスクスコアと全ゲノム関連研究
Geffen Kleinstern1,2, Dennis P Robinson2, Rania Abu Seir3
1Faculty of Social Welfare and Health Sciences, School of Public Health, University of Haifa, Haifa, Israel.
非ホジキンリンパ腫 (NHL) のサブタイプに対する多遺伝子リスクスコア (PRS) は,イスラエル系ユダヤ人とパレスチナ系アラブ人の間で有意な関連性を示したが,ヨーロッパ系祖先と比較して効果の大きさは弱まった. 統合GWASでは,DLBCLリスクに対する新しい遺伝的位置が特定されました.
科学分野:
- 遺伝学と疫学
- 癌 研究
- 人口遺伝学
背景:
- 全ゲノム関連研究 (GWAS) は,ヨーロッパ系 (EA) の集団におけるノンホッジキンリンパ腫 (NHL) の遺伝的リスク要因を特定した.
- EA集団から得られた確立された単一の核酸多型 (SNPs) と多遺伝子リスクスコア (PRSs) は,他の民族集団におけるNHLリスクを完全に捉えることができない.
- 遺伝的傾向の民族的多様性を理解することは リスクの正確な予測と パーソナライズされた医療に不可欠です
研究 の 目的:
- イスラエル・ユダヤ人 (IJ) とパレスチナ・アラブ人 (PA) で,EA由来SNPに基づいて,サブタイプ特有のPRSのパフォーマンスを評価する.
- IJとPAの集団を組み合わせてGWASを実施し,NHLリスクに関連する新しい遺伝的位置を特定する.
- 拡散型大B細胞リンパ腫 (DLBCL),葉細胞リンパ腫 (FL),および限界ゾーンリンパ腫 (MZL) の遺伝的構造における民族的差異を評価する.
主な方法:
- IJとPAコホートからの病理的に確認されたDLBCL,FL,MZLの症例とコントロールの遡及分析.
- EAから派生したSNP効果の見積もりを使用して,サブタイプ特有のPRSの計算.
- 関連する混同因子に調整したロジスティック回帰モデルを使用してPRS関連性を評価した. GWASは,結合された民族グループで行われました.
主要な成果:
- DLBCLでは1. 69の倍率,FLでは2. 21の倍率,MZLでは2. 26の倍率で,サブタイプ特有のPRSは,結合されたIJとPAコホートにおける対応するNHLサブタイプと有意に関連していた.
- PRSの効果の大きさは,EA集団で報告されたものと比較して弱まり,IJとPAの間で変化を示した.
- 結合された民族集団におけるGWASは,DLBCLリスクに関連した6p21. 32ロカスで2つの新しいSNPを特定しました.
結論:
- 亜型特異的なPRSは,IJとPAの集団におけるNHLリスクとの関連が有意であるが弱められていることを示し,遺伝的傾向における民族的多様性を強調する.
- 6p21.32ロカスにおける新しいSNPの識別は,DLBCLの遺伝的基盤に関する新しい洞察を提供します.
- ユダヤ人とアラブ人の集団でのGWASのさらなる研究は,これらの代表が不足している集団におけるNHLの遺伝的リスク予測の正確性を高めるために正当化されています.
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