ヘルシストグラム・トライアヌレラ (Lepidoptera: Gelechiidae) の染色体スケールのゲノムアセンブリ

Ying Wang¹, Jinjun Cao², Baoni Qin¹

¹Henan International Joint Laboratory of Taxonomy and Systematic Evolution of Insecta, Henan Institute of Science and Technology, Henan, 453003, China.

Scientific data

|August 31, 2025

まとめ

この研究は,重要な農業害虫であるHelcystogramma triannulellaの最初の染色体規模のゲノムアセンブリを提示しています. このゲノム資源は害虫の生物学を理解し効果的な制御戦略を開発するのに役立ちます

科学分野:

ゲノミクス
農業昆虫学
害虫対策

背景:

ヘルシストグラム・トリアヌレラ (Helcystogramma triannulella) は,コンボルヴラセア (Convolvulaceae) の作物の破壊的な害虫であり,かなりの経済的損失を引き起こしている.
限られたゲノム資源は,H.triannulellaの生物学と効果的な害虫対策戦略の理解を妨げています.

研究の目的:

ヘルシストグラム・トリアヌレラ (Helcystogramma triannulella) の最初の染色体規模のゲノムアセンブリを生成する.
研究と害虫管理のための貴重なゲノム資源を提供すること.

主な方法:

PacBio HiFiとHi-Cのシーケンシング技術が使用されました.
クロモソームスケールアセンブリは,Hi-Cアシスト・スキャフォルディングによって達成された.
タンパク質をコードする遺伝子と重複要素は注釈された.

主要な成果:

387.28 Mbのゲノムアセンブリが高い連続性で生成された (コンティグ N50: 2.28 Mb,エスカフォールド N50: 12.75 Mb).
アセンブリの91.77%は 30の染色体に固定されていました
このアセンブリは極めて完全であり (BUSCO: 96.2%),14211の注釈されたタンパク質をコードする遺伝子が含まれており,その49.02%が重複要素として識別されている.

結論:

H.triannulellaの染色体スケールのゲノムアセンブリは重要な進歩である.
このゲノム情報源は,害虫生物学に関する将来の研究と,標的型害虫管理戦略の開発を容易にするでしょう.

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