純粋な機能を展開する際にHL7 FHIR RDFリソースを使用するプロトタイプETLパイプラインは,患者データの知識グラフを豊かにします
Adeel Ansari1, Marisa Conte2, Allen Flynn2
1Krembil Centre for Neuroinformatics, Centre for Addiction and Mental Health, 250 College St., Toronto, ON, M5T 1R8, Canada. adeel.ansari@camh.ca.
新しいデータパイプラインは 計算可能な機能の純粋な関数を用いて 患者の知識グラフを豊かにします これは臨床研究における透明で標準に基づいたデータ処理を促進します.
科学分野:
- 生物医学情報学
- データサイエンス
- 臨床研究情報学
背景:
- 知識グラフ (KG) は,臨床ケアと研究に価値があります.
- 患者データでKGを充実させるには,体系的で透明な方法が必要です.
- 既存のオントロジーとデータ規格を活用することで,意味的相互運用性が促進されます.
研究 の 目的:
- KGの濃縮のための新しいデータ処理パイプラインを開発し,テストする.
- 既存のKGに新しい患者の特徴の計算と統合を可能にします.
- 透明なデータ処理のための標準ベースの方法の使用を実証する.
主な方法:
- 新しい患者の特徴を抽出し,計算し,返すためのデータ処理パイプラインを開発しました.
- 大規模なKG内の電子医療記録と患者調査データを活用した.
- 従業員の健康レベル7のデータ表示と検証のためのFHIR RDF標準.
主要な成果:
- 患者のKGを豊かにするためのパイプラインを成功裏に実装し,テストしました.
- FHIRによって指定されたRDFデータリソースのプログラム認証が実証されています.
- パイプラインの能力を示し 患者レベルでの新しい特徴を表現しました
結論:
- 知識グラフ技術は,標準ベースのセマンティックデータ処理パイプラインで強化できます.
- 純粋な機能を展開し,新しい患者の特徴を導き出すことができます.
- セマンティックデータ処理パイプラインは,関連メタデータによる新しい患者の計算に関する報告を容易にする.
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