イギリスの獣医センターにおける抗菌剤耐性に対するOne Healthのメタゲノムアプローチ

科学分野:

• 獣医学微生物学
• ゲノム流行病学
• "つの健康

背景:

• ワンヘルスにおける抗菌剤耐性 (AMR) のゲノム監視に関する標準化されたガイドラインは存在しない.
• 伴侶動物の遺伝子分布を理解することは,公衆と動物の健康にとって極めて重要です.

研究 の 目的:

• 動物病院でAMR遺伝子を特定するためにメタゲノミクスを利用する.
• メタゲノミクスの発見を,臨床単離から得られた現象性耐性データと比較する.
• 病院の異なる領域におけるAMR遺伝子の分布を評価する.

主な方法:

• オックスフォード・ナノポール・テクノロジーズ・ミニオンによる DNA 配列解析
• AMR遺伝子,プラズミド,病原体種に関するバイオ情報分析
• 細菌の表型特異化と抗生物質感受性試験との比較

主要な成果:

• 検出された一般的なAMR遺伝子は,aph,sul,blaCARB,tet,およびblaTEMである.
• β - ラクタムに対するフェノタイプの耐性は,臨床単離体において高かった.
• 動物を扱った地域は 動物を扱わない地域よりも 抗菌剤耐性遺伝子を多く持っていました

結論:

• メタゲノミクスは,獣医学におけるAMR遺伝子,プラズミッド,および関連する種を効果的に特定します.
• 共同で動物を扱っている地域では,感染予防と感染制御の対策を集中的に行う必要があります.
• 強化された浄化と消毒プロトコルは,AMR遺伝子の存在を減らすことができます.