ゲノム全体の関連研究を用いて,イランのホルシュタイン牛の体細胞数と乳生産に影響を与える候補遺伝子ネットワークの特定

科学分野:

• 動物ゲノム学
• 定量遺伝学
• 乳牛の繁殖

背景:

• ゲノム・ワイド・アソシエーション・スタディ (GWAS) は,様々な現象型に関連したゲノム領域を特定するための強力なツールです.
• イランのホルシュタイン乳牛の 生産特性の遺伝的メカニズムを理解することは 牛乳の生産量と品質を改善するために不可欠です
• 乳の生産量,脂肪の割合,タンパク質の割合,体細胞数に影響を与える特定の遺伝子を特定することは,遺伝子の改善に不可欠です.

研究 の 目的:

• イランのホルシュタイン牛の乳産量 (MY),乳脂率 (FP),乳タンパク質率 (PP),体細胞数 (SCC) に関連するゲノム領域,遺伝子,経路を特定する.
• これらの特性の包括的な分析のために単段階のGWASアプローチを使用します.
• 将来の家畜育種プログラムのための新しい単一ヌクレオチドポリモルフィズム (SNP) マーカーを発見する.

主な方法:

• 30Kと50KのSNP配列を用いて210頭のイランのホルシュタイン牛の遺伝子型を決定した.
• 1000 Bull Genomes Projectのリファレンスパネルを使用して,全ゲノム配列レベルにゲノタイプを割り算し,6,583,595の高信頼性SNPを割り算しました.
• 単段階GWAS分析を行い,P < 1 × 10−8の有意度値を示した.

主要な成果:

• MY,FP,PP,SCCに関連した10の染色体全体で184の有意なSNPマーカーを特定しました.
• MY,FP,PP,SCCでそれぞれ86,18,22および58の重要なSNPを特定しました.
• FP,PP,MY,SCCの有意なSNP付近の候補遺伝子を特定し,ATE1,FGFR2,およびLYZは乳首の健康と乳の品質にとって重要なものです.

結論:

• この研究では,イランのホルシュタイン牛の乳生産と健康特性に関連した新しいSNPと候補遺伝子を成功裏に特定しました.
• ATE1,FGFR2,LYZのような遺伝子は,ゲノム選択のマーカーとして有望であり,病気に対する耐性を改善します.
• この発見は 将来の乳牛の繁殖プログラムと ウーバーの健康管理を 強化するための貴重な遺伝資源を提供します