エチオピアにおける手術部位感染患者の間における拡張スペクトルベータ・ラクタマース産生グラム陰性細菌の分子疫学:多センター前向き研究
Seble Worku1,2,3, Tamrat Abebe4, Alemseged Abdissa5
1Department of Microbiology, Immunology and Parasitology, College of Health Sciences, School of Medicine, Addis Ababa University, Addis Ababa, Ethiopia. workuseble@ymail.com.
グラム陰性細菌を生成する拡張スペクトルベータ・ラクタメーゼ (ESBL) は,公衆衛生上の重大な懸念事項である. この研究では,エチオピアの手術部位感染でESBLを産生するGNBの高い割合が確認され,抗菌管理の改善の必要性を強調した.
科学分野:
- 微生物学
- 感染症
- ゲノミクス
背景:
- グラム陰性細菌 (GNB) を産生する拡張スペクトルベータ・ラクタメーゼ (ESBL) は,世界的に重大な公衆衛生上の脅威となっている.
- 手術部位感染 (SSI) は手術の一般的な合併症であり,GNBは頻繁に発生する原因です.
研究 の 目的:
- エチオピアで手術部位に感染した患者から分離されたESBL産生GNBの特徴を明らかにする.
- これらの単離物におけるESBL遺伝子の遺伝子型頻度と分子疫学を決定する.
主な方法:
- エチオピアの4つの病院で752人のSSI患者を含む多センター横断研究.
- 傷の培養を行い,MALDI-TOFを用いて286個のGNB分離が確認された.
- 全ゲノム配列決定 (Illumina HiSeq 2500) は135個のGNB単離体で実施された.
主要な成果:
- ESBLを生成するGNBの全体的な遺伝子型頻度は57.8%であった.
- blaCTX-M (51. 8%), blaTEM (40%), blaSHV (8. 1%) が最も多く検出されたESBL遺伝子でした.
- blaCTX-M-15は, blaTEM-1B (41%) と blaSHV-187 (5.1%) とともに,最も頻繁に発生するESBL遺伝子変異種でした.
結論:
- エチオピアの手術部位感染におけるESBLを生成するGNBの分子疫学は,多様なESBL遺伝子変異を明らかにしています.
- ESBLを産生するGNBの効果的な治療には,強力な抗菌管理プログラムと標準化された細菌検査サービスが必要です.
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