メキシコ市の排水と人口感染傾向におけるSARS-CoV-2検出の時間動態

科学分野:

• 環境科学
• 公衆衛生
• 分子生物学

背景:

• 排水ベースの疫学 (WBE) は,コミュニティレベルでの感染症の監視のための非侵襲的な方法を提供します.
• 排水中のSARS-CoV-2をモニタリングすることで,COVID-19の発生を早期に警告することができます.

研究 の 目的:

• 排水中のSARS-CoV-2 RNAレベルとメキシコシティで報告されたCOVID-19症例の間の時間的関係を調査する.
• 公衆衛生の介入のための早期警告システムとしてのWBEの有用性を評価する.

主な方法:

• 2つのCOVID-19の波でコピルコ地区から40個の排水サンプルを集めました.
• SARS-CoV-2検出のためのN1遺伝子を標的とした最適化された1段階RT-qPCRプロトコルを使用した.
• ドレナージトポロジーに基づく空間分類を適用し,交差相関分析を行った.

主要な成果:

• RT- qPCRプロトコルは高効率 (96. 7%) と低検出限界 (10コピー/μL) を示した.
• クロス・コレレーション・アナリストは,廃棄水のウイルスRNAレベルと報告されたCOVID-19症例の間の 6-8 日間の有意な時間的な遅れを明らかにした.
• 排水システム内の3つの異なる近接区域を特定した.

結論:

• WBEは,コミュニティレベルでのCOVID-19のような感染症のモニタリングのための貴重なツールです.
• 特定されたタイムラグは,感染傾向を予測する早期警告システムとしてのWBEの役割を支持しています.
• 発見は,公衆衛生戦略とパンデミック中の資源配分に情報を与えることができます.