マサチューセッツ州の野生,有機,従来の生態系からのクランベリー果物の腐敗菌の多様性をマルチプレックスPCRを用いて比較分析

科学分野:

• 植物病理学
• 菌類学
• 農業科学

背景:

• クランベリーの腐れは,特にマサチューセッツ州とニュージャージー州で,クランベリーの生産に影響を与える重要な疾患です.
• この病気は様々な菌群によって引き起こされ,果物の品質と収穫量に様々な影響を及ぼします.
• これらの菌類の集団動態を 異なる農業システムで理解することは 効果的な病気管理に不可欠です

研究 の 目的:

• 野生,有機,従来のクランベリー生産システムにおけるCFR菌群の動態に関する最初の包括的な評価を行う.
• CFRキノコの発生率,多様性,および年次持続性を,高通量分子法を用いて調査する.
• 異なるクランベリー生態系が菌類のコミュニティ構造と動態に及ぼす影響を分析する.

主な方法:

• マルチプレックスPCRを用いて11種類の一般的なCFR菌を同時に検出した.
• 2021年と2022年に,従来型,有機型,野生型を含む32種および50種のクランベリー沼地で真菌群を分析した.
• 各生態系において,種の豊かさ,多様性,そして年間間における真菌の持続性を計算した.

主要な成果:

• 生態系全体でCFR真菌の検出の有意な差異が観察され,野生の沼地はより高い種の豊かさと多様性を示した.
• 従来の畑では,果物の腐敗率が変動した (2021年には2~42%,2022年には1~48%).
• 野生の沼地では,従来の沼地 (6/11) と有機沼地 (4/11) に比べて,菌類の伝播率が高く, *Coleophoma empetri*, *Botryosphaeria vaccinii*,および *Allantophomopsis cytisporea* はすべてのタイプで顕著な持続性を示した.

結論:

• クランベリー果物の腐敗菌群は,野生,有機,従来の生産システムで異なるダイナミクスを表しています.
• 管理慣行はキノコの多様性と持続性に影響し,野生の沼地はより大きなキノコの複雑性をサポートしています.
• 重要な病原体である"C.エペトリ"と"B.バクチニ"は,著しい持続性を示し,標的型管理戦略の必要性を強調しています.