ミシガン州全域で10年以上にわたり 腸内細菌のプラズミド拡散を追跡

科学分野:

• 微生物学
• ゲノミクス
• 流行病学

背景:

• カーバペネマースを生成する腸内細菌 (KPC) は,プラズミドと流行の系統を通して広がる重大な脅威です.
• 抗菌剤耐性 (AMR) と戦うために,KPCの拡散のダイナミクスを理解することは不可欠です.

研究 の 目的:

• ミシガン州の医療施設におけるKPC負担に対するクローン伝播とプラズミド伝播の10年間の貢献度を決定する.
• 多様な細菌種に共通する KPC プラズミッドとその宿主を特定する.

主な方法:

• ミシガン州47の医療施設から1,058のKPC生成単離体の全ゲノムシーケンシング (2013-2022年).
• 正確なプラズミド追跡を可能にする 527 個の単離物の長読み配列化.
• プラズミドの種類と宿主範囲を特定するためにMOB-suiteを用いたプラズミド分析.

主要な成果:

• 64種類のKPCプラズミドが特定され,AK975が最も一般的であった (単離物の27%).
• AK975プラズミドは20種と92の配列型で発見され,その70%は非流行性系である.
• 疫病的な系統は,単離物の46%を占め,異なるプラズミド伝達と,特定のKPCプラズミドによる明確なクローン拡張を示した.

結論:

• KPCの拡散は,特定のプラズミドと, AK975のようなプラズミドの広範な拡散の両方で発生します.
• 種間のプラズミドを追跡する縦断的な研究は,医療環境におけるAMR伝播経路の包括的な理解に不可欠です.
• 伝統的な監視は,希少な種や系統によるKPCの拡散を見逃す可能性があり,包括的なゲノム監視の必要性を強調しています.