フィロダイナミクスと歴史的記録を統合すると,数十年前からコスタリカに国際豚取引を通じてPRRSVが導入されていたことが明らかになる

科学分野:

• 獣医ウイルス学
• 分子疫学
• フィロダイナミクス

背景:

• 1995 年 の 解剖 検査 に よる と,コスタリカ の 仔豚 に 呼吸 器,肺 炎,腹腔 炎,関節 炎 の 損傷 が 見 られ まし た.
• 1996年の流行は抗生物質の使用につながり,死亡率の分析は年次変動を示したが,有意な季節的なパターンはなかった.
• 輸入された母豚の仔豚の死亡率は,非輸入の母豚と輸入の母豚の死亡率 (8.11%) よりも高かった.

研究 の 目的:

• コスタリカにおける豚生殖呼吸器症候群ウイルス2型 (PRRSV-2) の進化的および空間時間的動態を調査する.
• 豚の国際移動がPRRSV-2の導入と進化に及ぼす影響を分析する.
• BEAST パッケージと統合された植物動力学フレームワークを利用して包括的な分析を行う.

主な方法:

• 2019-2021年の見通し研究から得た10のPRRSV-2 ORF5配列の分析.
• ウイルスの導入時間と進化パターンを推定するための植物動力学的モデル化.
• 国際的な豚の移動データとゲノム配列解析を統合する.

主要な成果:

• フィロダイナミックモデリングは,少なくとも2つの独立したPRRSV-2がコスタリカに導入されたことを示した.
• 1978年頃,おそらく日本から米国産豚の輸出を経て,最も早く導入され,1CRCの系統が生まれた.
• 1991年頃に米国から第二の導入が,3CRCクラスタを設立し,4CRCクラスタはコスタリカ内の1CRC系統から生まれました.

結論:

• 国際的な豚取引は,PRRSV-2の導入と進化の重要な要因です.
• ゲノム監視は病原体の動態を理解し,生物安全プロトコルに情報を提供するために不可欠です.
• この研究は,世界の家畜貿易に関連した病原体拡散の高解像度モデルを提供します.