韓国におけるCP4-EPSPSを含むハイブリッドと野生型のブラシカ・ジャンセアのホロバイオントによるバクテリアと真菌の微生物群データセット
Jihoon Kim1,2, Kyong-Hee Nam1, Jun-Woo Lee1
1LMO Team, National Institute of Ecology, 1210 Geumgang-ro, Maseo-myeon, Seocheon 33657, Republic of Korea.
Data in brief
|September 2, 2025
まとめ
この研究では,野生型およびハイブリッド型B. junceaの細菌および真菌群のプロファイルが示されています. 植物と微生物の相互作用を理解するための ベースラインを提供しています
科学分野:
- 微生物学
- 植物学
- 遺伝学
背景:
- 遺伝子変化によるB. napusとB. junceaのハイブリッド化が報告され,生態学的懸念が生じています.
- ハイブリッドのホロビオント構造を理解することは 環境への影響の評価に不可欠です
研究 の 目的:
- CP4-EPSPSを含むハイブリッドと野生型の *B. juncea* に関連する細菌と真菌のコミュニティを包括的にプロファイルする.
- 道路沿いの自然生息地における微生物コミュニティのベースラインデータセットを確立する.
- 野生型のホロビオンと ハイブリッドの構造について 洞察を深めるため
主な方法:
- 野生のタイプとハイブリッドの *B. juncea* 個体から120個のホロバイオント (花,葉,根,土) を採取した.
- Illumina Miseqは細菌の16S rRNAとキノコのITS遺伝子の配列化に使用されました.
- DADA2パイプラインを用いた処理されたアンプリコン配列変種 (ASV)
主要な成果:
- バクテリアのASVは15131種,真菌のASVは5353種.
- プロテオバクテリアとアスコミコタはそれぞれ 主要な細菌群と真菌群であった.
- 野生型のホロビオンとハイブリッドの*B.ジャンセア*の異なる微生物群のプロファイルが特徴付けられています.
結論:
- このデータセットは,野生型およびハイブリッドの *B. juncea* ホロビオントの微生物コミュニティの包括的なベースラインを提供します.
- 自然環境における ホロビオントの構造に 新たな洞察を与えてくれる
- 植物のハイブリッド化の生態学的影響を理解するために重要です.
さらに関連する動画
09:55Exploring the Root Microbiome: Extracting Bacterial Community Data from the Soil, Rhizosphere, and Root Endosphere
Published on: May 2, 2018
27.2K
07:19Compost Microcosms as Microbially Diverse, Natural-like Environments for Microbiome Research in Caenorhabditis elegans
Published on: September 13, 2022
2.3K
関連する概念動画
Microorganisms in Agriculture and Food industry
339
Microorganisms play a crucial role in agriculture and the food industry, contributing to soil fertility, crop protection, and food production. Their functions range from nitrogen fixation and biopesticide production to fermentation and food preservation, making them indispensable to sustainable farming and food safety.Role in AgricultureNitrogen-fixing bacteria, such as Rhizobium (symbiotic) and Azotobacter (free-living), convert atmospheric nitrogen into ammonia through biological nitrogen...
339
The Roles of Bacteria and Fungi in Plant Nutrition
40.8K
Plants have the impressive ability to create their own food through photosynthesis. However, plants often require assistance from organisms in the soil to acquire the nutrients they need to function correctly. Both bacteria and fungi have evolved symbiotic relationships with plants that help the species to thrive in a wide variety of environments.
40.8K
Diversity of Protists IV
118
Amoebozoa represent a diverse group of terrestrial and aquatic protists that utilize lobe-shaped pseudopodia for locomotion and feeding. This characteristic differentiates them from the Rhizaria, which possess threadlike pseudopodia. The primary classifications within Amoebozoa include gymnamoebas, entamoebas, and the plasmodial and cellular slime molds. Phylogenetic evidence indicates that Amoebozoa diverged from a lineage that ultimately gave rise to fungi and animals.Gymnamoebas and...
118
Environmental Applications of Microorganisms
222
Microorganisms play a pivotal role in maintaining ecosystem balance by recycling essential elements such as carbon, nitrogen, and phosphorus, as well as supporting processes like bioremediation, wastewater treatment, and biofuel production.Microbes in Elemental CyclesIn the carbon cycle, microorganisms decompose organic matter, releasing carbon dioxide via aerobic respiration. This carbon dioxide is subsequently used by photosynthetic organisms to synthesize organic compounds, closing the...
222
