ドイツの患者コホートにおける重複関連アタクシアは,標的型並列ロングリードシーケンシングで分析された

科学分野:

• 遺伝学とゲノミクス
• 神経学
• 分子診断

背景:

• 遺伝性成人発症性アタキシアは,繰り返し発症する疾患の多様なグループです.
• PCRのような現在の診断方法は 労働集約的で 精度が不足しています
• ロングリードシーケンシング (LRS) は正確な遺伝分析のための有望な代替手段です.

研究 の 目的:

• 成人発症性アタキシア患者の再発拡大を分析するために,臨床ナノ孔Cas9標的配列 (Clin- CATS) の診断的有用性を評価する.
• 既知の再発性アタクシアの頻度と,後退性疾患のキャリア周波数を決定する.
• フェノタイプを特徴付け,新しい繰り返し構成を特定する.

主な方法:

• 513人の成人発症性アタクシア患者のコホートで臨床ナノ孔Cas9標的配列解析 (Clin- CATS) を利用した.
• 病原性の拡大を特定するために並行して深度分析を繰り返した.
• さらに347人の患者に特定の再発拡大 (ZFHX3) を配列化しました.

主要な成果:

• RFC1スペクトル障害とSCA27Bを含む稀有型および有病性アタキシアは,患者の33. 3%で確認された.
• 4. 7% の患者で潜在的に病原性FGF14の拡大が認められたが,SCA4は特定されなかった.
• 二重診断は6. 4%の患者で観察され,RFC1スペクトル障害の高頻度 (7. 2%) と,フリードライヒのアタクシアの低頻度 (0. 8%) が再評価されました.

結論:

• ロングリードシーケンシング (LRS) は,遺伝性アタキシアの総合的な再分析に重要な診断上の利点を提供します.
• LRSは臨床遺伝学の標準として採用され,サザンブロットやPCRのような古い方法に置き換えられるべきです.
• 診断の精度を高めるために,遺伝子型-フェノタイプ相関の再評価と,繰り返し長さを超えるパラメータの含有が推奨されます.