Jove
Visualize
お問い合わせ
JoVE
x logofacebook logolinkedin logoyoutube logo
JoVEについて
概要リーダーシップブログJoVEヘルプセンター
著者向け
出版プロセス編集委員会範囲と方針査読よくある質問投稿
図書館員向け
推薦の声購読アクセスリソース図書館諮問委員会よくある質問
研究
JoVE JournalMethods CollectionsJoVE Encyclopedia of Experimentsアーカイブ
教育
JoVE CoreJoVE BusinessJoVE Science EducationJoVE Lab Manual教員リソースセンター教員サイト
利用規約
プライバシーポリシー
ポリシー

関連する概念動画

RNA-seq03:21

RNA-seq

10.4K
RNA sequencing, or RNA-Seq, is a high-throughput sequencing technology used to study the transcriptome of a cell. Transcriptomics helps to interpret the functional elements of a genome and identify the molecular constituents of an organism. Additionally, it also helps in understanding the development of an organism and the occurrence of diseases. 
Before the discovery of RNA-seq, microarray-based methods and Sanger sequencing were used for transcriptome analysis. However, while...
10.4K
Ribosome Profiling02:24

Ribosome Profiling

3.6K
Ribosome profiling or ribo-sequencing is a deep sequencing technique that produces a snapshot of active translation in a cell. It selectively sequences the mRNAs protected by ribosomes to get an insight into a cell’s translation landscape at any given point in time.
Applications of ribosome profiling
Ribosome profiling has many applications, including in vivo monitoring of translation inside a particular organ or tissue type and quantifying new protein synthesis levels.
The technique...
3.6K

こちらも読む

関連記事

共著者、ジャーナル、引用グラフによってこの研究に関連する記事。

並び替え
Same author

Cattle and human organoids reveal 2.3.4.4b H5N1 cross-species transmission potential and neuraminidase-specific neutralizing antibodies in humans.

Nature communications·2026
Same author

Effects of Wushu Programs on Lower-Limb Explosive Power in Preschool Children Aged 5-6 Years: A Cluster-Randomized Controlled Trial.

Journal of functional morphology and kinesiology·2026
Same author

Photochemical C-P Bond Formation via Direct EDA Complexation between P-Reagents and Haloheteroarenes without Catalysts and Bases.

The Journal of organic chemistry·2026
Same author

Bridging the Gap Between Efficacy and Practice: A Systematic Review of Shared Decision-Making in Severe Mental Illness.

Journal of multidisciplinary healthcare·2026
Same author

Sex-Specific Outcomes and Treatment Responses in Elderly Patients With Heart Failure With Preserved Ejection Fraction: A Comprehensive Single-Center Retrospective Study.

Journal of the American Heart Association·2026
Same author

Magnetic hydrogel-mediated periodic stimulation enhances mesenchymal stem cell small extracellular vesicle release.

Materials today. Bio·2026

関連する実験動画

Updated: Sep 9, 2025

Author Spotlight: AQRNA-seq Role in Mapping Small RNAs and Unraveling Protein Translation Mechanisms
05:12

Author Spotlight: AQRNA-seq Role in Mapping Small RNAs and Unraveling Protein Translation Mechanisms

Published on: February 2, 2024

895

合成RNAを用いて,直接的なRNA配列からポリ (A) 長さの推論をベンチマークする

Jessie J-Y Chang1, Xuan Yang1, Haotian Teng2

  • 1Department of Microbiology and Immunology, University of Melbourne at The Peter Doherty Institute for Infection and Immunity, Melbourne, VIC, 3000, Australia.

GigaScience
|September 3, 2025
PubMed
まとめ

直接的なRNAシーケンシングデータを用いて4つのポリー・テール評価ツールをベンチマークした. ドラドは最高のパフォーマンスを示し,トランスクリプトーム解析の高速と高精度を提供しました.

キーワード:
オックスフォード・ナノポー・テクノロジーズ直接的なRNAシーケンシング評価する尾のポリー (A)セグメンテーション

さらに関連する動画

Identification of Alternative Splicing and Polyadenylation in RNA-seq Data
08:35

Identification of Alternative Splicing and Polyadenylation in RNA-seq Data

Published on: June 24, 2021

5.8K
Author Spotlight: Exploring the Frontier of mRNA Research with Poly A Tail Analysis Techniques
08:16

Author Spotlight: Exploring the Frontier of mRNA Research with Poly A Tail Analysis Techniques

Published on: January 12, 2024

1.1K

関連する実験動画

Last Updated: Sep 9, 2025

Author Spotlight: AQRNA-seq Role in Mapping Small RNAs and Unraveling Protein Translation Mechanisms
05:12

Author Spotlight: AQRNA-seq Role in Mapping Small RNAs and Unraveling Protein Translation Mechanisms

Published on: February 2, 2024

895
Identification of Alternative Splicing and Polyadenylation in RNA-seq Data
08:35

Identification of Alternative Splicing and Polyadenylation in RNA-seq Data

Published on: June 24, 2021

5.8K
Author Spotlight: Exploring the Frontier of mRNA Research with Poly A Tail Analysis Techniques
08:16

Author Spotlight: Exploring the Frontier of mRNA Research with Poly A Tail Analysis Techniques

Published on: January 12, 2024

1.1K

科学分野:

  • 分子生物学
  • バイオ情報学
  • ゲノミクス

背景:

  • ポリアデニレーションはRNAの調節に不可欠であり,mRNAの分解,トランスレーション,および同型特異性に影響を与える.
  • 直接的なRNAシーケンシングは,全長RNA分析を提供し,トランスクリプトーム全体にわたるポリアテール研究を可能にします.
  • 既存の多項評価ツールには,ゴールドスタンダードデータセットに対する包括的なベンチマークが欠けている.

研究 の 目的:

  • ボーストナノを導入します これはポリオの尾の長さの推定のための新しいディープラーニングツールです
  • 既知のツール (tailfindr,nanopolish) とディープラーニングツール (Dorado) と比較する.
  • 既知の多項A尾長を持つ合成RNA標準を用いて,ツール性能を評価する.

主な方法:

  • ボーストナノのディープラーニングモデルの開発
  • 4つのツール (BoostNano, tailfindr, nanopolish, Dorado) を合成RNAデータセット (Sequin, eGFP) で評価した.
  • 既知の地形真相によるツール精度の分析.

主要な成果:

  • 工具の性能は,ポリー (A) 尾の長さと試料の種類によって異なる.
  • 多重評価を平均すると 精度が向上します
  • Doradoは高速な実行時間,低平均誤差,使いやすさで優れたパフォーマンスを示しました.

結論:

  • ドラドは,直接のRNA配列決定において,ポリ (A) 尾の長さの推定を推奨する.
  • 正確なポリアテール分析は,トランスクリプトの安定性と調節を理解するために不可欠です.
  • このベンチマークは,トランスクリプトーム分析とRNAの規制研究を改善するための基準となる.