ダブルカルバペネマースを生成するEnterobacteriaceae:パラグアイの病院からの単離物の完全なゲノムシーケンシング,2021年

科学分野:

• ゲノミクス
• 微生物学
• 感染症

背景:

• エントロバクテリアの抗菌剤耐性は 世界的に懸念される問題です
• 全ゲノム配列解析 (WGS) は,耐性の遺伝的基盤について貴重な洞察を提供します.
• パラグアイにおけるカルバペネマース産生エンテロバクテリアに関するデータは限られている.

研究 の 目的:

• パラグアイの長期入院患者からの二重カルバペネマース生成エンテロバクテリア群の特徴をWGSを用いて特定する.
• 国内で流通している特定のカーバペネマース遺伝子とシーケンスのタイプを特定する.
• 耐性細菌のゲノム多様性と 感染の可能性を理解する

主な方法:

• ゲノムDNA抽出と全ゲノムシーケンシング
• ユニサイクラーアセンブリとマルチロカス配列型化 (MLST) を含むバイオ情報分析.
• PCRを用いたカルバペネマース遺伝子の確認

主要な成果:

• 7つの二重カルバペネマスを生成するEnterobacteriaceae単離体が配列化され,6つはKlebsiella pneumoniae亜種であった. 肺炎とエントロバクター・クロアカーの亜種 クロアケ
• K. pneumoniaeで blaKPC-2/blaNDM-1,E. cloacaeで blaNDM-1/blaOXA-163の共産が確認されている.
• MLSTは,ST11,ST15,ST133,ST273,ST1303のK. pneumoniaeとST976のE. cloacaeを含む多様な配列型を明らかにした. 異なる病院からの2つのK. pneumoniae ST11単離は遺伝的に関連していた.

結論:

• これはパラグアイでダブルカルバペネマースを生成するエンテロバクテリアに関する最初のWGS研究である.
• 発見は,多様な耐性プロファイル,クローン,および複数のカルバペネメーズおよび他の耐性遺伝子の存在を明らかにしています.
• 病院での感染制御を強化し,効果的な治療戦略を導入することは,これらの高耐性細菌の拡散と戦うために不可欠です.