ラテンアメリカの6カ国の臨床単離体における尿病原性エシェリキア・コライのゲノム多様性 (2018年−2023年)
Francesca Caballero1, Anne Martinez-Ventura1,2, Diego Cuicapuza1,3
1Universidad Peruana Cayetano Heredia, Laboratorio de Genómica Microbiana, Lima, Perú.
Revista peruana de medicina experimental y salud publica
|September 3, 2025
まとめ
ST131とST1193を含む高リスクの尿病原性大腸菌 (UPEC) のクローンは,ラテンアメリカで流行しています. ゲノム分析により,多剤耐性を持つ重要な変異が明らかになり,強化された監視の必要性が強調されました.
科学分野:
- 微生物学
- ゲノミクス
- 公衆衛生
背景:
- 尿路感染症 (UTI) の抗菌剤耐性が増加しているため,ラテンアメリカにおける尿路感染症 (UPEC) のゲノム監視が緊急に必要である.
- UPECに対する抗菌薬の有効性に関する公衆衛生上の懸念が高まっている.
研究 の 目的:
- ペルーからのUPECの臨床的単離物を遺伝的に特徴付ける.
- ペルーのUPECゲノムと他のラテンアメリカのUPECゲノム (2018年−2023年) を文脈化する.
主な方法:
- 16個のペルーのUPEC単離物の配列と組み立て
- ラテンアメリカから127の公開UPECゲノムを補完しました.
- 血清型,配列型 (ST),抗菌剤耐性 (AMR) 遺伝子,および変異の特定
- 進化的関係と系統群分布を決定する 系統遺伝分析
主要な成果:
- ST131 (42. 7%) とST1193 (13. 3%) が最も一般的な高リスクUPECクローンでした.
- フィルグループB2が優勢で (83. 2%),血清型O25:H4が顕著でした.
- 耐性遺伝子 (blaTEM-1,blaCTX-M-15,blaCTX-M-27) とフッ素ヒノロン耐性変異 (gyrA,parC) の高頻度,特にST131において
結論:
- ラテンアメリカにおける高リスクUPECクローン (ST131,ST1193) の高い流行
- 多剤耐性遺伝子と突然変異の有意な負荷が特定されました.
- 緊急にUPECの地域ゲノム監視を強化し 治療戦略を策定する必要があります
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