抗生物質感受性検査の万能薬として次世代配列化:はいか否か

科学分野:

• 臨床微生物学
• ゲノミクス
• 感染症

背景:

• 次世代のシーケンシング (NGS) 技術は,臨床微生物学の研究室でますます採用されています.
• 全ゲノムシーケンシング (WGS) は,種識別,定量化,微生物株の追跡を可能にします.
• WGSは,ウイルス性および抗菌剤耐性 (AMR) 遺伝子の検出を容易にし,ゲノム AST (gAST) を可能にします.

研究 の 目的:

• 臨床微生物学のNGSとGASTの現状を評価する.
• 伝統的な抗菌感受性検査 (AST) 方法論と比較してgASTの付加価値を評価する.
• gASTの臨床実施の要件について議論する.

主な方法:

• 臨床微生物学の現在のNGSとgASTアプリケーションのレビュー.
• gASTの技術的,データ管理,コスト,規制上の課題の評価
• gASTと確立されたフェノタイプのASTの比較

主要な成果:

• gASTの完全な診断実施は,現在,通常の研究室では実現できません.
• 技術的複雑性,データ管理,時間,費用対効果の改善が必要である.
• gASTは,現在,日常的な使用のために,迅速なフェノタイプのASTと組み合わせる必要があります.

結論:

• gASTは有望ですが,広範な臨床採用には大きな障害に直面しています.
• 規制当局の承認 (IVDR,FDA) と払い戻しは,市場へのアクセスを決定的に重要です.
• 容量を増やし,臨床的価値を定義し,採用を簡素化するためにさらなる開発が必要である.